論文の概要: e-Health CSIRO at "Discharge Me!" 2024: Generating Discharge Summary Sections with Fine-tuned Language Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.02723v1
- Date: Wed, 3 Jul 2024 00:32:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-04 17:54:48.148926
- Title: e-Health CSIRO at "Discharge Me!" 2024: Generating Discharge Summary Sections with Fine-tuned Language Models
- Title(参考訳): e-Health CSIRO at "Discharge Me!
- Authors: Jinghui Liu, Aaron Nicolson, Jason Dowling, Bevan Koopman, Anthony Nguyen,
- Abstract要約: BioNLP 2024 Shared Task on Streamlining Discharge Documentation (Discharge Me!
我々は,複数のオープンソース言語モデル (LM) を微調整し,デコーダのみとエンコーダのみを含む生成タスクにアプローチする。
その結果, 生成作業において, 目標区間に先行する放電概要の内容に対する条件付けが有効であることが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.547747400704174
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Clinical documentation is an important aspect of clinicians' daily work and often demands a significant amount of time. The BioNLP 2024 Shared Task on Streamlining Discharge Documentation (Discharge Me!) aims to alleviate this documentation burden by automatically generating discharge summary sections, including brief hospital course and discharge instruction, which are often time-consuming to synthesize and write manually. We approach the generation task by fine-tuning multiple open-sourced language models (LMs), including both decoder-only and encoder-decoder LMs, with various configurations on input context. We also examine different setups for decoding algorithms, model ensembling or merging, and model specialization. Our results show that conditioning on the content of discharge summary prior to the target sections is effective for the generation task. Furthermore, we find that smaller encoder-decoder LMs can work as well or even slightly better than larger decoder based LMs fine-tuned through LoRA. The model checkpoints from our team (aehrc) are openly available.
- Abstract(参考訳): 臨床文書は臨床医の日々の仕事の重要な側面であり、しばしばかなりの時間を要する。
BioNLP 2024 Shared Task on Streamlining Discharge Documentation (Discharge Me!) は、簡単な病院コースや退院指導を含む退院要領を自動生成し、手書きの合成や書き直しに時間がかかり、この文書の負担を軽減することを目的としている。
我々は,複数のオープンソース言語モデル(LM)を微調整し,デコーダのみとエンコーダとデコーダの両方を含む生成タスクにアプローチする。
また、復号アルゴリズム、モデルアンサンブル、マージ、モデル特殊化の異なる設定についても検討する。
その結果, 生成作業において, 目標区間に先行する放電概要の内容に対する条件付けが有効であることが示唆された。
さらに,より小型のエンコーダ・デコーダ LM は,LORA で微調整された大型のデコーダ LM よりも,さらに若干の精度で動作可能であることがわかった。
私たちのチーム(aehrc)のモデルチェックポイントは、公開されています。
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