論文の概要: Harmonizing Flows: Leveraging normalizing flows for unsupervised and source-free MRI harmonization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.15717v1
- Date: Mon, 22 Jul 2024 15:22:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-23 14:20:51.563973
- Title: Harmonizing Flows: Leveraging normalizing flows for unsupervised and source-free MRI harmonization
- Title(参考訳): ハーモナイズドフロー: 教師なし・ソースフリーMRIハーモニゼーションのための正規化フローの活用
- Authors: Farzad Beizaee, Gregory A. Lodygensky, Chris L. Adamson, Deanne K. Thompso, Jeanie L. Y. Cheon, Alicia J. Spittl. Peter J. Anderso, Christian Desrosier, Jose Dolz,
- Abstract要約: 本稿では,正規化フローを利用してMR画像を調整し,ソース領域の分布をエミュレートする非教師なしフレームワークを提案する。
提案する戦略は3つの重要なステップから構成される。
我々は、浅層ハーモナイザネットワークをトレーニングし、その拡張によるソースドメインからの画像を再構成する。
推論中、ハーモニザネットワークを更新し、出力画像が学習したソース領域分布に適合することを保証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.092355794195639
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Lack of standardization and various intrinsic parameters for magnetic resonance (MR) image acquisition results in heterogeneous images across different sites and devices, which adversely affects the generalization of deep neural networks. To alleviate this issue, this work proposes a novel unsupervised harmonization framework that leverages normalizing flows to align MR images, thereby emulating the distribution of a source domain. The proposed strategy comprises three key steps. Initially, a normalizing flow network is trained to capture the distribution characteristics of the source domain. Then, we train a shallow harmonizer network to reconstruct images from the source domain via their augmented counterparts. Finally, during inference, the harmonizer network is updated to ensure that the output images conform to the learned source domain distribution, as modeled by the normalizing flow network. Our approach, which is unsupervised, source-free, and task-agnostic is assessed in the context of both adults and neonatal cross-domain brain MRI segmentation, as well as neonatal brain age estimation, demonstrating its generalizability across tasks and population demographics. The results underscore its superior performance compared to existing methodologies. The code is available at https://github.com/farzad-bz/Harmonizing-Flows
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴(MR)画像取得における標準化の欠如と様々な固有のパラメータは、ディープニューラルネットワークの一般化に悪影響を及ぼす、様々な部位やデバイスにまたがる異種画像をもたらす。
この問題を軽減するために, 正規化フローを利用してMR画像の整合を図り, ソース領域の分布をエミュレートする新しい非教師付き調和フレームワークを提案する。
提案する戦略は3つの重要なステップから構成される。
当初、正規化フローネットワークは、ソースドメインの分布特性をキャプチャするために訓練される。
そして、浅層調和器ネットワークをトレーニングし、その拡張処理により、ソースドメインからの画像を再構成する。
最後に、推論中に、正規化フローネットワークによってモデル化された出力画像が学習したソース領域分布に適合するようにハーモニザネットワークを更新する。
本研究のアプローチは, 成人と新生児のクロスドメイン脳MRIセグメント, および新生児の脳年齢推定の文脈において, 教師なし, ソースレス, タスク非依存であり, タスクの一般化性を示すものである。
その結果,既存の手法に比べて優れた性能を示した。
コードはhttps://github.com/farzad-bz/Harmonizing-Flowsで入手できる。
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