論文の概要: UMMAN: Unsupervised Multi-graph Merge Adversarial Network for Disease Prediction Based on Intestinal Flora
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.21714v1
- Date: Wed, 31 Jul 2024 16:06:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-01 17:41:37.583663
- Title: UMMAN: Unsupervised Multi-graph Merge Adversarial Network for Disease Prediction Based on Intestinal Flora
- Title(参考訳): UMMAN:腸内フローラに基づく疾患予測のための教師なしマルチグラフマージアドバイサルネットワーク
- Authors: Dingkun Liu, Hongjie Zhou, Yilu Qu, Huimei Zhang, Yongdong Xu,
- Abstract要約: 我々は、新しいアーキテクチャ、unsupervised Multi-graph Adversarial Network (UMMAN)を提案する。
UMMANは、教師なしのシナリオでマルチグラフのノードの埋め込みを得ることができ、多重化関連を学習するのに役立ちます。
本稿では,ノード間の関係を乱し,対応するShuffled-Graphを生成するために,複雑な関係型を用いる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.18641315013048299
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The abundance of intestinal flora is closely related to human diseases, but diseases are not caused by a single gut microbe. Instead, they result from the complex interplay of numerous microbial entities. This intricate and implicit connection among gut microbes poses a significant challenge for disease prediction using abundance information from OTU data. Recently, several methods have shown potential in predicting corresponding diseases. However, these methods fail to learn the inner association among gut microbes from different hosts, leading to unsatisfactory performance. In this paper, we present a novel architecture, Unsupervised Multi-graph Merge Adversarial Network (UMMAN). UMMAN can obtain the embeddings of nodes in the Multi-Graph in an unsupervised scenario, so that it helps learn the multiplex association. Our method is the first to combine Graph Neural Network with the task of intestinal flora disease prediction. We employ complex relation-types to construct the Original-Graph and disrupt the relationships among nodes to generate corresponding Shuffled-Graph. We introduce the Node Feature Global Integration (NFGI) module to represent the global features of the graph. Furthermore, we design a joint loss comprising adversarial loss and hybrid attention loss to ensure that the real graph embedding aligns closely with the Original-Graph and diverges from the Shuffled-Graph. Comprehensive experiments on five classical OTU gut microbiome datasets demonstrate the effectiveness and stability of our method. (We will release our code soon.)
- Abstract(参考訳): 腸内細菌の豊富さはヒトの疾患と密接に関連しているが、単一の腸内微生物によって引き起こされるわけではない。
代わりに、多くの微生物の複雑な相互作用が引き起こされる。
腸内細菌間のこの複雑で暗黙的な結合は、OTUデータからの豊富な情報を用いた疾患予測に重大な課題をもたらす。
近年、いくつかの方法により、対応する疾患を予測できる可能性が示されている。
しかし、これらの方法は異なる宿主から腸内微生物の内的関連を学ばず、不満足なパフォーマンスをもたらす。
本稿では,Unsupervised Multi-graph Merge Adversarial Network (UMMAN)を提案する。
UMMANは、教師なしのシナリオでマルチグラフのノードの埋め込みを得ることができ、多重化関連を学習するのに役立ちます。
本手法は,グラフニューラルネットと腸内フローラ病予測を併用した最初の手法である。
本稿では,ノード間の関係を乱し,対応するShuffled-Graphを生成するために,複雑な関係型を用いる。
グラフのグローバル機能を表現するため,Node Feature Global Integration (NFGI) モジュールを紹介した。
さらに,実グラフの埋め込みがオリジナルグラフと密接に一致し,シャッフルグラフから分岐することを保証するために,対向損失とハイブリッドアテンション損失を含む共同損失を設計する。
従来のOTU腸内マイクロバイオームデータセットの総合的な実験により,本手法の有効性と安定性が示された。
(まもなくコードを公開します。)
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