論文の概要: Geo-UNet: A Geometrically Constrained Neural Framework for Clinical-Grade Lumen Segmentation in Intravascular Ultrasound
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.04826v1
- Date: Fri, 9 Aug 2024 02:55:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-12 16:48:31.535307
- Title: Geo-UNet: A Geometrically Constrained Neural Framework for Clinical-Grade Lumen Segmentation in Intravascular Ultrasound
- Title(参考訳): Geo-UNet : 血管内超音波における臨床用グルーメン切開のための幾何学的拘束型ニューラルネットワークフレームワーク
- Authors: Yiming Chen, Niharika S. D'Souza, Akshith Mandepally, Patrick Henninger, Satyananda Kashyap, Neerav Karani, Neel Dey, Marcos Zachary, Raed Rizq, Paul Chouinard, Polina Golland, Tanveer F. Syeda-Mahmood,
- Abstract要約: UNetのような現在のセグメンテーションネットワークは、IVUSにおける臨床応用に必要な精度を欠いている。
そこで我々はGeo-UNetフレームワークを提案する。
静脈性IVUSデータセットに対する我々のフレームワークの有効性を,最先端モデルに対して示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.760705377465734
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Precisely estimating lumen boundaries in intravascular ultrasound (IVUS) is needed for sizing interventional stents to treat deep vein thrombosis (DVT). Unfortunately, current segmentation networks like the UNet lack the precision needed for clinical adoption in IVUS workflows. This arises due to the difficulty of automatically learning accurate lumen contour from limited training data while accounting for the radial geometry of IVUS imaging. We propose the Geo-UNet framework to address these issues via a design informed by the geometry of the lumen contour segmentation task. We first convert the input data and segmentation targets from Cartesian to polar coordinates. Starting from a convUNet feature extractor, we propose a two-task setup, one for conventional pixel-wise labeling and the other for single boundary lumen-contour localization. We directly combine the two predictions by passing the predicted lumen contour through a new activation (named CDFeLU) to filter out spurious pixel-wise predictions. Our unified loss function carefully balances area-based, distance-based, and contour-based penalties to provide near clinical-grade generalization in unseen patient data. We also introduce a lightweight, inference-time technique to enhance segmentation smoothness. The efficacy of our framework on a venous IVUS dataset is shown against state-of-the-art models.
- Abstract(参考訳): 深部静脈血栓症(DVT)に対する介入ステントの縮小には,血管内超音波(IVUS)における路面境界の正確な推定が必要である。
残念ながら、UNetのような現在のセグメンテーションネットワークは、IVUSワークフローにおける臨床応用に必要な精度を欠いている。
これは、IVUS画像の放射形状を考慮に入れながら、限られた訓練データから正確な路面輪郭を自動的に学習することの難しさから生じる。
そこで本稿では,ジオUNet フレームワークを提案し,これらの問題にルーメン輪郭分節タスクの幾何学的特徴を生かした設計手法を提案する。
まず、入力データとセグメンテーションターゲットをカルテシアンから極座標に変換する。
convUNet特徴抽出器から、従来のピクセルワイドラベリングのための2タスク構成と、単一境界ルーメン-輪郭ローカライゼーションのための2タスク構成を提案する。
予測ルーメン輪郭を新しいアクティベーション(CDFeLU)に通すことで、この2つの予測を直接組み合わせて、鮮明なピクセルワイズ予測をフィルタリングする。
我々の統合的損失関数は、エリアベース、距離ベース、および輪郭ベースの罰則を慎重にバランスさせ、不明な患者データにおいて、ほぼ臨床グレードの一般化を提供する。
また,セグメンテーションの平滑性を高める軽量な推論時間手法も導入した。
静脈性IVUSデータセットに対する我々のフレームワークの有効性を,最先端モデルに対して示す。
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