論文の概要: BeyondCT: A deep learning model for predicting pulmonary function from chest CT scans
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.05645v1
- Date: Sat, 10 Aug 2024 22:28:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-13 18:01:49.059499
- Title: BeyondCT: A deep learning model for predicting pulmonary function from chest CT scans
- Title(参考訳): BeyondCT:胸部CTによる肺機能予測のためのディープラーニングモデル
- Authors: Kaiwen Geng, Zhiyi Shi, Xiaoyan Zhao, Alaa Ali, Jing Wang, Joseph Leader, Jiantao Pu,
- Abstract要約: BeyondCT モデルは,非造影胸部CT から1秒間 (FEV1) の強制活量および強制呼気量を予測するために開発された。
肺機能予測には非造影胸部CT検査が有用であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.602923751641061
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Abstract Background: Pulmonary function tests (PFTs) and computed tomography (CT) imaging are vital in diagnosing, managing, and monitoring lung diseases. A common issue in practice is the lack of access to recorded pulmonary functions despite available chest CT scans. Purpose: To develop and validate a deep learning algorithm for predicting pulmonary function directly from chest CT scans. Methods: The development cohort came from the Pittsburgh Lung Screening Study (PLuSS) (n=3619). The validation cohort came from the Specialized Centers of Clinically Oriented Research (SCCOR) in COPD (n=662). A deep learning model called BeyondCT, combining a three-dimensional (3D) convolutional neural network (CNN) and Vision Transformer (ViT) architecture, was used to predict forced vital capacity (FVC) and forced expiratory volume in one second (FEV1) from non-contrasted inspiratory chest CT scans. A 3D CNN model without ViT was used for comparison. Subject demographics (age, gender, smoking status) were also incorporated into the model. Performance was compared to actual PFTs using mean absolute error (MAE, L), percentage error, and R square. Results: The 3D-CNN model achieved MAEs of 0.395 L and 0.383 L, percentage errors of 13.84% and 18.85%, and R square of 0.665 and 0.679 for FVC and FEV1, respectively. The BeyondCT model without demographics had MAEs of 0.362 L and 0.371 L, percentage errors of 10.89% and 14.96%, and R square of 0.719 and 0.727, respectively. Including demographics improved performance (p<0.05), with MAEs of 0.356 L and 0.353 L, percentage errors of 10.79% and 14.82%, and R square of 0.77 and 0.739 for FVC and FEV1 in the test set. Conclusion: The BeyondCT model showed robust performance in predicting lung function from non-contrast inspiratory chest CT scans.
- Abstract(参考訳): 肺機能検査(PFT)とCT画像検査(CT)は肺疾患の診断、管理、モニタリングに不可欠である。
一般的な問題は、胸部CT検査が利用可能であるにもかかわらず、記録された肺機能へのアクセスの欠如である。
目的:胸部CTスキャンから直接肺機能を予測するための深層学習アルゴリズムの開発と検証を行う。
方法: 開発コホートはピッツバーグ肺検診 (PLuSS) (n=3619) のものである。
検証コホートは COPD (n=662) のSCCOR (Specialized Centers of Clinically Oriented Research) から得られた。
BeyondCTと呼ばれるディープラーニングモデルは、3次元畳み込みニューラルネットワーク(CNN)とビジョントランスフォーマー(ViT)アーキテクチャを組み合わせたもので、非造影胸部CTスキャンから強制活量(FVC)と1秒間強制呼気量(FEV1)を予測するために用いられた。
ViTのない3次元CNNモデルを用いて比較を行った。
対象者(年齢、性別、喫煙状況)もモデルに組み込まれた。
平均絶対誤差(MAE, L), パーセンテージ誤差(R乗)を用いて実PFTと比較した。
結果: 3D-CNNモデルでは, 0.395 L, 0.383 L, パーセンテージ誤差13.84%, 18.85%, R正方形0.665, 0.679をFVCとFEV1でそれぞれ達成した。
人口統計のないBeyondCTモデルでは、MAEは0.362 L、0.371 L、パーセンテージエラーは10.89%、14.96%、R平方は0.719、0.727であった。
人口動態の改善 (p<0.05), MAEsが0.356 L, 0.353 L, 10.79%, 14.82%, R squareが0.77, 0.739であった。
結語:BeyondCTモデルでは非造影胸部CT検査より肺機能の予測が困難であった。
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