論文の概要: Persistence Image from 3D Medical Image: Superpixel and Optimized Gaussian Coefficient
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.07905v1
- Date: Thu, 15 Aug 2024 03:24:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-16 15:09:23.228379
- Title: Persistence Image from 3D Medical Image: Superpixel and Optimized Gaussian Coefficient
- Title(参考訳): 3次元医用画像からの永続画像:超画素と最適化ガウス係数
- Authors: Yanfan Zhu, Yash Singh, Khaled Younis, Shunxing Bao, Yuankai Huo,
- Abstract要約: トポロジカルデータ分析(TDA)は、医用画像における物体の重要な性質を明らかにする。
これまでの研究は主に2D画像解析に焦点を合わせ、包括的な3Dコンテキストを無視していた。
医用画像の特徴を点クラウドデータに変換するために,スーパーピクセルの概念を取り入れた革新的な3D TDA手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.808587330262038
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Topological data analysis (TDA) uncovers crucial properties of objects in medical imaging. Methods based on persistent homology have demonstrated their advantages in capturing topological features that traditional deep learning methods cannot detect in both radiology and pathology. However, previous research primarily focused on 2D image analysis, neglecting the comprehensive 3D context. In this paper, we propose an innovative 3D TDA approach that incorporates the concept of superpixels to transform 3D medical image features into point cloud data. By Utilizing Optimized Gaussian Coefficient, the proposed 3D TDA method, for the first time, efficiently generate holistic Persistence Images for 3D volumetric data. Our 3D TDA method exhibits superior performance on the MedMNist3D dataset when compared to other traditional methods, showcasing its potential effectiveness in modeling 3D persistent homology-based topological analysis when it comes to classification tasks. The source code is publicly available at https://github.com/hrlblab/TopologicalDataAnalysis3D.
- Abstract(参考訳): トポロジカルデータ分析(TDA)は、医用画像における物体の重要な性質を明らかにする。
永続的ホモロジーに基づく手法は、従来の深層学習法が放射線学と病理学の両方で検出できないトポロジ的特徴を捉える上で、その利点を証明している。
しかし、従来の研究では、総合的な3Dコンテキストを無視した2D画像解析に重点を置いていた。
本稿では,3次元医用画像の特徴を点クラウドデータに変換するために,スーパーピクセルの概念を取り入れた革新的な3D TDA手法を提案する。
最適化されたガウス係数を利用することで,提案した3次元TDA法は,3次元容積データに対する総合パーシステンス画像を効率よく生成する。
我々の3D TDA法は,従来の手法と比較してMedMNist3Dデータセットよりも優れた性能を示し,分類タスクにおける3D持続ホモロジーに基づくトポロジ解析のモデル化の有効性を示した。
ソースコードはhttps://github.com/hrlblab/TopologicalDataAnalysis3Dで公開されている。
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