論文の概要: A Survey for Large Language Models in Biomedicine
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.00133v1
- Date: Thu, 29 Aug 2024 12:39:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-06 16:50:17.438306
- Title: A Survey for Large Language Models in Biomedicine
- Title(参考訳): バイオメディシンにおける大規模言語モデルの探索
- Authors: Chong Wang, Mengyao Li, Junjun He, Zhongruo Wang, Erfan Darzi, Zan Chen, Jin Ye, Tianbin Li, Yanzhou Su, Jing Ke, Kaili Qu, Shuxin Li, Yi Yu, Pietro Liò, Tianyun Wang, Yu Guang Wang, Yiqing Shen,
- Abstract要約: このレビューは、PubMed、Web of Science、arXivなどのデータベースから得られた484の出版物の分析に基づいている。
我々は、診断支援、薬物発見、パーソナライズドメディカル医療を含む幅広いバイオメディカル・タスクにおいて、ゼロショット学習におけるLLMの能力について検討する。
データプライバシの懸念、限定されたモデル解釈可能性、データセットの品質の問題、倫理など、LLMがバイオメディシック領域で直面する課題について論じる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.719451674137844
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recent breakthroughs in large language models (LLMs) offer unprecedented natural language understanding and generation capabilities. However, existing surveys on LLMs in biomedicine often focus on specific applications or model architectures, lacking a comprehensive analysis that integrates the latest advancements across various biomedical domains. This review, based on an analysis of 484 publications sourced from databases including PubMed, Web of Science, and arXiv, provides an in-depth examination of the current landscape, applications, challenges, and prospects of LLMs in biomedicine, distinguishing itself by focusing on the practical implications of these models in real-world biomedical contexts. Firstly, we explore the capabilities of LLMs in zero-shot learning across a broad spectrum of biomedical tasks, including diagnostic assistance, drug discovery, and personalized medicine, among others, with insights drawn from 137 key studies. Then, we discuss adaptation strategies of LLMs, including fine-tuning methods for both uni-modal and multi-modal LLMs to enhance their performance in specialized biomedical contexts where zero-shot fails to achieve, such as medical question answering and efficient processing of biomedical literature. Finally, we discuss the challenges that LLMs face in the biomedicine domain including data privacy concerns, limited model interpretability, issues with dataset quality, and ethics due to the sensitive nature of biomedical data, the need for highly reliable model outputs, and the ethical implications of deploying AI in healthcare. To address these challenges, we also identify future research directions of LLM in biomedicine including federated learning methods to preserve data privacy and integrating explainable AI methodologies to enhance the transparency of LLMs.
- Abstract(参考訳): 大規模言語モデル(LLM)の最近のブレークスルーは、前例のない自然言語の理解と生成能力を提供する。
しかしながら、生物医学におけるLCMに関する既存の調査は、しばしば特定のアプリケーションやモデルアーキテクチャに焦点を当て、様々な生物医学領域における最新の進歩を統合する包括的な分析を欠いている。
このレビューは、PubMed、Web of Science、arXivなどのデータベースから得られた484の出版物の分析に基づいて、バイオメディシンにおけるLLMの現在の展望、応用、課題、展望を詳細に検証し、実際の生体医学的文脈におけるこれらのモデルの実践的意味に焦点を当てて、自分自身を区別する。
まず, 診断支援, 薬物発見, パーソナライズドメディカル医療など, 幅広いバイオメディカル・タスクにおいて, ゼロショット学習におけるLCMの能力について, 137 つの重要な研究から考察した。
そこで,本研究では,一様・多様両方のLDMを微調整して,ゼロショットが達成できない特殊なバイオメディカルコンテキストにおいて,医療質問応答やバイオメディカル文献の効率的な処理など,それらの性能を向上させることを含むLCMの適応戦略について論じる。
最後に、データプライバシの懸念、モデル解釈可能性の制限、データセットの品質の問題、バイオメディカルデータのセンシティブな性質による倫理、信頼性の高いモデル出力の必要性、医療におけるAI導入の倫理的影響など、LLMがバイオメディシック領域で直面する課題について議論する。
これらの課題に対処するために、我々は、データのプライバシーを維持するためのフェデレートされた学習方法や、LLMの透明性を高めるための説明可能なAI方法論の統合を含む、バイオメディシンにおけるLLMの今後の研究方向も特定する。
関連論文リスト
- BIOMEDICA: An Open Biomedical Image-Caption Archive, Dataset, and Vision-Language Models Derived from Scientific Literature [73.39593644054865]
BIOMEDICAはスケーラブルでオープンソースのフレームワークで、PubMed Central Open Accessサブセット全体を抽出、注釈付け、シリアライズして、使いやすく、公開可能なデータセットにする。
われわれのフレームワークは600万以上の記事から2400万以上のユニークな画像テキストペアで包括的なアーカイブを生成する。
BMCA-CLIPは、ストリーミングを通じてBIOMEDICAデータセット上で継続的に事前トレーニングされたCLIPスタイルのモデルのスイートで、27TBのデータをローカルにダウンロードする必要がなくなる。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-01-13T09:58:03Z) - Large Language Models for Bioinformatics [58.892165394487414]
本調査はバイオインフォマティクス特化言語モデル(BioLM)の進化,分類,特徴の識別に焦点をあてる。
疾患診断, 薬物発見, ワクチン開発などの重要な分野において, バイオフィルムの幅広い応用について検討する。
データプライバシやセキュリティ上の問題,解釈可能性の問題,トレーニングデータやモデル出力のバイアス,ドメイン適応複雑性など,BioLMに固有の重要な課題や制限を特定します。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-01-10T01:43:05Z) - A Review on Scientific Knowledge Extraction using Large Language Models in Biomedical Sciences [1.8308043661908204]
本稿では,生物医学領域における大規模言語モデル(LLM)の最先端応用について概説する。
LLMは、幻覚、文脈理解、一般化する能力など、大きな可能性を秘めているが、大きな課題が残っている。
我々は、医療文献へのアクセスを改善し、医療における有意義な発見を促進することを目的としている。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-12-04T18:26:13Z) - A Survey of Medical Vision-and-Language Applications and Their Techniques [48.268198631277315]
医療ビジョン・アンド・ランゲージモデル(MVLM)は、複雑な医療データを解釈するための自然言語インタフェースを提供する能力から、大きな関心を集めている。
本稿では,MVLMの概要と適用した各種医療課題について概観する。
また、これらのタスクに使用するデータセットについても検討し、標準化された評価指標に基づいて異なるモデルの性能を比較した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-11-19T03:27:05Z) - From Text to Multimodality: Exploring the Evolution and Impact of Large Language Models in Medical Practice [14.739357670600103]
大規模言語モデル(LLM)は、テキストベースのシステムからマルチモーダルプラットフォームへと急速に進化してきた。
医療におけるMLLMの現況を考察し,臨床診断支援,医用画像,患者エンゲージメント,研究の分野にまたがる応用を分析した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-09-14T02:35:29Z) - Explainable Biomedical Hypothesis Generation via Retrieval Augmented Generation enabled Large Language Models [46.05020842978823]
大規模言語モデル(LLM)はこの複雑なデータランドスケープをナビゲートする強力なツールとして登場した。
RAGGEDは、知識統合と仮説生成を伴う研究者を支援するために設計された包括的なワークフローである。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-07-17T07:44:18Z) - Large Language Models in Biomedical and Health Informatics: A Review with Bibliometric Analysis [24.532570258954898]
大規模言語モデル(LLM)は、バイオメディカル・ヘルスインフォマティクス(BHI)において、急速に重要なツールになりつつある。
本研究の目的は、BHIにおけるLLM応用の総合的な概要を提供し、その変容の可能性を強調し、関連する倫理的・実践的課題に対処することである。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-24T21:29:39Z) - An Evaluation of Large Language Models in Bioinformatics Research [52.100233156012756]
本研究では,大規模言語モデル(LLM)の性能について,バイオインフォマティクスの幅広い課題について検討する。
これらのタスクには、潜在的なコーディング領域の同定、遺伝子とタンパク質の命名されたエンティティの抽出、抗微生物および抗がんペプチドの検出、分子最適化、教育生物情報学問題の解決が含まれる。
以上の結果から, GPT 変種のような LLM がこれらのタスクの多くをうまく処理できることが示唆された。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-02-21T11:27:31Z) - Large Language Models Illuminate a Progressive Pathway to Artificial
Healthcare Assistant: A Review [16.008511195589925]
大規模言語モデル(LLM)は、人間のレベルの言語理解と推論を模倣する有望な能力を示している。
本稿では,医学におけるLSMの応用と意義について概説する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-11-03T13:51:36Z) - Interpretability from a new lens: Integrating Stratification and Domain
knowledge for Biomedical Applications [0.0]
本稿では, バイオメディカル問題データセットの k-fold cross-validation (CV) への階層化のための新しい計算手法を提案する。
このアプローチはモデルの安定性を改善し、信頼を確立し、トレーニングされたIMLモデルによって生成された結果の説明を提供する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-03-15T12:02:02Z) - Machine Learning in Nano-Scale Biomedical Engineering [77.75587007080894]
ナノスケールバイオメディカルエンジニアリングにおける機械学習の利用に関する既存の研究について概説する。
ML問題として定式化できる主な課題は、3つの主要なカテゴリに分類される。
提示された方法論のそれぞれについて、その原則、応用、制限に特に重点を置いている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-08-05T15:45:54Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。