論文の概要: Automated quality assessment using appearance-based simulations and hippocampus segmentation on low-field paediatric brain MR images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.06161v1
- Date: Tue, 8 Oct 2024 16:07:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-01 10:50:51.603203
- Title: Automated quality assessment using appearance-based simulations and hippocampus segmentation on low-field paediatric brain MR images
- Title(参考訳): 低磁場小児脳MRI画像における外見に基づくシミュレーションと海馬セグメンテーションを用いた自動品質評価
- Authors: Vaanathi Sundaresan, Nicola K Dinsdale,
- Abstract要約: 1) 自動品質保証と2) 海馬のセグメンテーションの2つの課題について検討し, 複数のアプローチを比較した。
自動品質保証タスクでは、DenseNetと外観ベースの変換を組み合わせることで、82.3%の重み付け精度で最高のパフォーマンスを実現した。
以上の結果から, 画像は大規模病理と大規模解剖学的発達の理解を提供することができるが, より粒度の細かい解析には依然として障壁が残っていることが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.06269281581001895
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Understanding the structural growth of paediatric brains is a key step in the identification of various neuro-developmental disorders. However, our knowledge is limited by many factors, including the lack of automated image analysis tools, especially in Low and Middle Income Countries from the lack of high field MR images available. Low-field systems are being increasingly explored in these countries, and, therefore, there is a need to develop automated image analysis tools for these images. In this work, as a preliminary step, we consider two tasks: 1) automated quality assurance and 2) hippocampal segmentation, where we compare multiple approaches. For the automated quality assurance task a DenseNet combined with appearance-based transformations for synthesising artefacts produced the best performance, with a weighted accuracy of 82.3%. For the segmentation task, registration of an average atlas performed the best, with a final Dice score of 0.61. Our results show that although the images can provide understanding of large scale pathologies and gross scale anatomical development, there still remain barriers for their use for more granular analyses.
- Abstract(参考訳): 小児脳の構造的成長を理解することは、様々な神経発達障害の同定における重要なステップである。
しかし、我々の知識は、特に低所得国や中所得国における自動画像解析ツールの欠如や、高磁場MR画像の欠如など、多くの要因によって制限されている。
ローフィールドシステムはこれらの国で研究が進んでいるため、画像の自動解析ツールを開発する必要がある。
この作業では、予備的なステップとして、2つのタスクを検討します。
1【品質保証の自動化】
2) 海馬のセグメンテーションでは, 複数のアプローチを比較した。
自動品質保証タスクでは、DenseNetと外見に基づく人工物合成の変換を組み合わせることで、82.3%の重み付き精度で最高のパフォーマンスを実現した。
セグメンテーションタスクでは、平均アトラスの登録が最高であり、最終Diceスコアは0.61である。
以上の結果から, 画像は大規模病理と大規模解剖学的発達の理解を提供することができるが, より粒度の細かい解析には依然として障壁が残っていることが示唆された。
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