論文の概要: Preserving Cardiac Integrity: A Topology-Infused Approach to Whole Heart Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.10551v2
- Date: Thu, 17 Oct 2024 23:07:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-10-29 20:55:06.296149
- Title: Preserving Cardiac Integrity: A Topology-Infused Approach to Whole Heart Segmentation
- Title(参考訳): 心臓の整合性保存 : トポロジーを応用した全心セグメンテーション法
- Authors: Chenyu Zhang, Wenxue Guan, Xiaodan Xing, Guang Yang,
- Abstract要約: 全心セグメンテーション(WHS)は、心臓血管疾患の診断、疾患のモニタリング、治療計画、予後をサポートする。
本稿では,深層ニューラルネットワークに統合された新しいトポロジ保存モジュールを提案する。
この実装は、学習したトポロジ保存フィールドを用いて、完全に3次元の畳み込みに基づいており、3次元のボクセルデータに対して非常に効果的である、解剖学的に妥当なセグメンテーションを実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.495726693226574
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Whole heart segmentation (WHS) supports cardiovascular disease (CVD) diagnosis, disease monitoring, treatment planning, and prognosis. Deep learning has become the most widely used method for WHS applications in recent years. However, segmentation of whole-heart structures faces numerous challenges including heart shape variability during the cardiac cycle, clinical artifacts like motion and poor contrast-to-noise ratio, domain shifts in multi-center data, and the distinct modalities of CT and MRI. To address these limitations and improve segmentation quality, this paper introduces a new topology-preserving module that is integrated into deep neural networks. The implementation achieves anatomically plausible segmentation by using learned topology-preserving fields, which are based entirely on 3D convolution and are therefore very effective for 3D voxel data. We incorporate natural constraints between structures into the end-to-end training and enrich the feature representation of the neural network. The effectiveness of the proposed method is validated on an open-source medical heart dataset, specifically using the WHS++ data. The results demonstrate that the architecture performs exceptionally well, achieving a Dice coefficient of 0.939 during testing. This indicates full topology preservation for individual structures and significantly outperforms other baselines in preserving the overall scene topology.
- Abstract(参考訳): 全心セグメンテーション(WHS)は、心血管疾患(CVD)の診断、疾患のモニタリング、治療計画、予後をサポートする。
近年、深層学習はWHSアプリケーションにおいて最も広く使われている手法となっている。
しかし、心拍周期における心拍変動、運動やコントラスト/ノイズ比の低下、マルチセンターデータの領域シフト、CTとMRIの相違など、多くの課題に直面している。
これらの制限に対処し、セグメンテーションの品質を向上させるために、ディープニューラルネットワークに統合された新しいトポロジ保存モジュールを導入する。
この実装は、学習したトポロジ保存フィールドを用いて、完全に3次元の畳み込みに基づいており、3次元のボクセルデータに対して非常に効果的である、解剖学的に妥当なセグメンテーションを実現する。
構造間の自然な制約をエンドツーエンドのトレーニングに組み込んで、ニューラルネットワークの特徴表現を強化します。
提案手法の有効性を,WHS++データを用いたオープンソース医療心臓データセットを用いて検証した。
その結果, 性能は極めて良好であり, 試験中のDice係数は0.939であることがわかった。
これは、個々の構造に対する完全なトポロジー保存を示し、シーントポロジー全体の保存において他のベースラインを著しく上回っていることを示している。
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