論文の概要: Modeling 3D cardiac contraction and relaxation with point cloud
deformation networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.10927v1
- Date: Thu, 20 Jul 2023 14:56:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-21 12:42:23.439739
- Title: Modeling 3D cardiac contraction and relaxation with point cloud
deformation networks
- Title(参考訳): 点雲変形ネットワークを用いた三次元心収縮と緩和のモデリング
- Authors: Marcel Beetz, Abhirup Banerjee, Vicente Grau
- Abstract要約: 本稿では,3次元心収縮と緩和をモデル化する新しい幾何学的深層学習手法として,ポイントクラウド変形ネットワーク(PCD-Net)を提案する。
英国バイオバンクの調査から,1万件以上の症例の大規模データセットに対するアプローチを評価した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.65840670565844
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Global single-valued biomarkers of cardiac function typically used in
clinical practice, such as ejection fraction, provide limited insight on the
true 3D cardiac deformation process and hence, limit the understanding of both
healthy and pathological cardiac mechanics. In this work, we propose the Point
Cloud Deformation Network (PCD-Net) as a novel geometric deep learning approach
to model 3D cardiac contraction and relaxation between the extreme ends of the
cardiac cycle. It employs the recent advances in point cloud-based deep
learning into an encoder-decoder structure, in order to enable efficient
multi-scale feature learning directly on multi-class 3D point cloud
representations of the cardiac anatomy. We evaluate our approach on a large
dataset of over 10,000 cases from the UK Biobank study and find average Chamfer
distances between the predicted and ground truth anatomies below the pixel
resolution of the underlying image acquisition. Furthermore, we observe similar
clinical metrics between predicted and ground truth populations and show that
the PCD-Net can successfully capture subpopulation-specific differences between
normal subjects and myocardial infarction (MI) patients. We then demonstrate
that the learned 3D deformation patterns outperform multiple clinical
benchmarks by 13% and 7% in terms of area under the receiver operating
characteristic curve for the tasks of prevalent MI detection and incident MI
prediction and by 7% in terms of Harrell's concordance index for MI survival
analysis.
- Abstract(参考訳): 射出率のような臨床で一般的に用いられる心機能のグローバルな単価バイオマーカーは、真の3d心臓変形過程に関する限られた洞察を与え、健康的および病理学的心臓力学の両方の理解を制限している。
本研究では,3次元心収縮と心周期の極端間緩和をモデル化する新しい幾何学的深層学習手法として,point cloud deformation network (pcd-net)を提案する。
心臓解剖学のマルチクラス3Dポイントクラウド表現上で,効率的なマルチスケール特徴学習を実現するために,ポイントクラウドベースの深層学習をエンコーダ・デコーダ構造に応用した。
我々は,英国バイオバンクの調査から,1万件を超える大規模データセットに対するアプローチを評価し,画像取得の画素解像度以下の予測真理解剖学と地上真理解剖学の間の平均チャンファー距離を求める。
以上の結果から,pcd-netは正常者と心筋梗塞患者との間に有意なサブポピュレーション特異的な差を捉えることができた。
得られた3次元変形パターンは,MI検出および入射MI予測のタスクにおいて,受信機動作特性曲線の領域で13%,7%,ハーレルのMI生存分析におけるコンコーダンス指標で7%,複数の臨床ベンチマークで13%,7%を上回った。
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