論文の概要: AtlasSeg: Atlas Prior Guided Dual-U-Net for Cortical Segmentation in Fetal Brain MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.02867v2
- Date: Tue, 11 Mar 2025 02:25:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-12 15:39:59.813457
- Title: AtlasSeg: Atlas Prior Guided Dual-U-Net for Cortical Segmentation in Fetal Brain MRI
- Title(参考訳): AtlasSeg: 胎児脳MRIにおける皮質切開のためのDual-U-Netの事前ガイド
- Authors: Haoan Xu, Tianshu Zheng, Xinyi Xu, Yao Shen, Jiwei Sun, Cong Sun, Guangbin Wang, Zhaopeng Cui, Dan Wu,
- Abstract要約: 既存のセグメンテーションネットワークは、年齢に関する特徴を暗黙的に学習するのみである。
我々は、GA固有の情報をガイダンスとして明示的に統合した二重U字型畳み込みネットワークであるAtlasSegを紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 26.806048154974707
- License:
- Abstract: Accurate automatic tissue segmentation in fetal brain MRI is a crucial step in clinical diagnosis but remains challenging, particularly due to the dynamically changing anatomy and tissue contrast during fetal development. Existing segmentation networks can only implicitly learn age-related features, leading to a decline in accuracy at extreme early or late gestational ages (GAs). To improve segmentation performance throughout gestation, we introduce AtlasSeg, a dual-U-shape convolution network that explicitly integrates GA-specific information as guidance. By providing a publicly available fetal brain atlas with segmentation labels corresponding to relevant GAs, AtlasSeg effectively extracts age-specific patterns in the atlas branch and generates precise tissue segmentation in the segmentation branch. Multi-scale spatial attention feature fusions are constructed during both encoding and decoding stages to enhance feature flow and facilitate better information interactions between two branches. We compared AtlasSeg with six well-established networks in a seven-tissue segmentation task, achieving the highest average Dice similarity coefficient of 0.91. The improvement was particularly evident in extreme early or late GA cases, where training data was scare. Furthermore, AtlasSeg exhibited minimal performance degradation on low-quality images with contrast changes and noise, attributed to its anatomical shape priors. Overall, AtlasSeg demonstrated enhanced segmentation accuracy, better consistency across fetal ages, and robustness to perturbations, making it a powerful tool for reliable fetal brain MRI tissue segmentation, particularly suited for diagnostic assessments during early gestation.
- Abstract(参考訳): 胎児脳MRIにおける正確な自動組織分画は、臨床診断において重要なステップであるが、特に胎児発生時の解剖学的および組織コントラストの動的変化により、依然として困難である。
既存のセグメンテーションネットワークは、年齢に関連する特徴を暗黙的に学習することしかできず、極早または後期妊娠年齢(GA)では精度が低下する。
妊娠中におけるセグメンテーション性能を向上させるために、GA固有情報をガイダンスとして明示的に統合した二重U字型畳み込みネットワークであるAtlasSegを導入する。
関連するGAに対応するセグメンテーションラベルを有する公用胎児脳アトラスを提供することにより、アトラスブランチの年齢特異的パターンを効果的に抽出し、セグメンテーションブランチの正確な組織セグメンテーションを生成する。
符号化段階と復号段階の両方において,マルチスケールの空間的注意特徴融合が構築され,特徴フローが向上し,二つの枝間の情報相互作用が向上する。
我々は、AtlasSegを7つの分割タスクで6つの確立されたネットワークと比較し、平均Dice類似度係数0.91を達成した。
この改善は、トレーニングデータが不足していた極端早期または後期のGA症例で顕著であった。
さらに、AtlasSegは、その解剖学的形状によるコントラスト変化とノイズを伴う低品質画像に対して、最小の性能劣化を示した。
全体として、AtlasSegは、セグメンテーションの精度の向上、胎児年齢間の整合性の向上、摂動に対する堅牢性を示し、妊娠初期の診断に特に適した、信頼できる胎児脳MRI組織セグメンテーションのための強力なツールとなった。
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