論文の概要: Graph Neural Network Surrogates to leverage Mechanistic Expert Knowledge towards Reliable and Immediate Pandemic Response
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.06500v2
- Date: Tue, 22 Apr 2025 09:51:12 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-23 19:51:40.143358
- Title: Graph Neural Network Surrogates to leverage Mechanistic Expert Knowledge towards Reliable and Immediate Pandemic Response
- Title(参考訳): グラフニューラルネットワークによる機械的知識の信頼性と即時パンデミック応答への活用
- Authors: Agatha Schmidt, Henrik Zunker, Alexander Heinlein, Martin J. Kühn,
- Abstract要約: 我々は,空間的かつ人口統計学的に解決された伝染病のメタポピュレーションモデルを構築し,パンデミックの予防接種期を表すデータセットのためのグラフニューラルネットワークを訓練する。
このアプローチはオンザフライ実行に大きな可能性をもたらし、パンデミックの意思決定に使用するローバリアWebアプリケーションへの統合を容易にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.94295877935867
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: During the COVID-19 crisis, mechanistic models have guided evidence-based decision making. However, time-critical decisions in a dynamical environment limit the time available to gather supporting evidence. Infectious disease dynamics are often heterogeneous on a spatial or demographic scale, requiring appropriately resolved models. In addition, with a large number of potential interventions, all scenarios can barely be computed on time, even when using supercomputing facilities. We suggest to couple complex mechanistic models with data-driven surrogate models to allow for on-the-fly model adaptations by public health experts and decision makers. We build upon a spatially and demographically resolved infectious disease metapopulation model and train a graph neural network for data sets representing prevaccination phases of a pandemic. The resulting networks reached an execution time of a fraction of a second, a speeding up the metapopulation up to four orders of magnitude. The approach yields large potential for on-the-fly execution and, thus, facilitates integration into low-barrier web applications for use in pandemic decision-making.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルス(COVID-19)危機の間、メカニスティックモデルは証拠に基づく意思決定をガイドしてきた。
しかし、動的環境における時間的決定は、証拠を収集するのに利用可能な時間を制限する。
感染症のダイナミクスは、しばしば空間的または人口的スケールで不均一であり、適切に解決されたモデルを必要とする。
加えて、潜在的な介入が多々あるため、スーパーコンピュータ設備を使用しても、すべてのシナリオを時間通りに計算することはほとんどできない。
我々は、公衆衛生の専門家や意思決定者によるオンザフライモデル適応を可能にするために、データ駆動サロゲートモデルと複雑なメカニスティックモデルを組み合わせることを提案する。
我々は,空間的かつ人口統計学的に解決された伝染病のメタポピュレーションモデルを構築し,パンデミックの予防接種期を表すデータセットのためのグラフニューラルネットワークを訓練する。
結果として得られたネットワークは1秒程度の実行時間に達し、メタポピュレーションを最大4桁に高速化した。
このアプローチはオンザフライ実行に大きな可能性をもたらし、パンデミックの意思決定に使用するローバリアWebアプリケーションへの統合を容易にする。
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