論文の概要: Uncertainty quantification for White Matter Hyperintensity segmentation detects silent failures and improves automated Fazekas quantification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.17571v1
- Date: Tue, 26 Nov 2024 16:34:24 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-27 13:36:19.283718
- Title: Uncertainty quantification for White Matter Hyperintensity segmentation detects silent failures and improves automated Fazekas quantification
- Title(参考訳): ホワイトマター高強度セグメンテーションの不確かさ定量化はサイレント障害を検出し、自動ファゼカス定量化を改善する
- Authors: Ben Philps, Maria del C. Valdes Hernandez, Chen Qin, Una Clancy, Eleni Sakka, Susana Munoz Maniega, Mark E. Bastin, Angela C. C. Jochems, Joanna M. Wardlaw, Miguel O. Bernabeu, Alzheimers Disease Neuroimaging Initiative,
- Abstract要約: ホワイトマター・ハイパーインテンシティ(White Matter Hyperintensities、WMH)は、脳MRIに存在する小血管疾患の主要な神経放射線学的マーカーである。
WMHは, 形状, 位置, サイズ, 未定義境界, および他の病理と類似の強度プロファイルにより, セグメンテーションが困難である。
WMHの不確実性情報を組み込むことで,ファゼカス分類性能と校正性能が向上することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.1773635209430036
- License:
- Abstract: White Matter Hyperintensities (WMH) are key neuroradiological markers of small vessel disease present in brain MRI. Assessment of WMH is important in research and clinics. However, WMH are challenging to segment due to their high variability in shape, location, size, poorly defined borders, and similar intensity profile to other pathologies (e.g stroke lesions) and artefacts (e.g head motion). In this work, we apply the most effective techniques for uncertainty quantification (UQ) in segmentation to the WMH segmentation task across multiple test-time data distributions. We find a combination of Stochastic Segmentation Networks with Deep Ensembles yields the highest Dice and lowest Absolute Volume Difference % (AVD) score on in-domain and out-of-distribution data. We demonstrate the downstream utility of UQ, proposing a novel method for classification of the clinical Fazekas score using spatial features extracted for WMH segmentation and UQ maps. We show that incorporating WMH uncertainty information improves Fazekas classification performance and calibration, with median class balanced accuracy for classification models with (UQ and spatial WMH features)/(spatial WMH features)/(WMH volume only) of 0.71/0.66/0.60 in the Deep WMH and 0.82/0.77/0.73 in the Periventricular WMH regions respectively. We demonstrate that stochastic UQ techniques with high sample diversity can improve the detection of poor quality segmentations. Finally, we qualitatively analyse the semantic information captured by UQ techniques and demonstrate that uncertainty can highlight areas where there is ambiguity between WMH and stroke lesions, while identifying clusters of small WMH in deep white matter unsegmented by the model.
- Abstract(参考訳): ホワイトマター・ハイパーインテンシティ(White Matter Hyperintensities、WMH)は、脳MRIに存在する小血管疾患の主要な神経放射線学的マーカーである。
WMHの評価は研究や診療において重要である。
しかし、WMHは、形状、位置、大きさ、定義の不十分な境界線、他の病理(例えば脳卒中病変)やアーチファクト(例えば頭部運動)と類似した強度プロファイルのため、セグメンテーションが困難である。
本研究では,複数のテスト時間データ分布にまたがるWMHセグメンテーションタスクに対して,セグメンテーションにおける不確実性定量化(UQ)に最も効果的な手法を適用する。
確率分割ネットワークとDeep Ensemblesの組み合わせにより,ドメイン内およびアウト・オブ・ディストリビューションデータ上でのDiceとAbsolute Volume difference %(AVD)スコアが最も高い。
WMHセグメンテーションとUQマップから抽出した空間的特徴を用いて臨床ファゼカススコアの分類法を提案する。
深部WMHでは0.71/0.66/0.60, 室周囲WMHでは0.82/0.77/0.73であった。
サンプルの多様性が高い確率的UQ技術は、品質の低いセグメンテーションの検出を改善できることを実証する。
最後に,UQ手法が捉えた意味情報を質的に分析し,WMHと脳卒中病変のあいまいさのある領域を浮き彫りにし,そのモデルが未解決の深部白質物質中の小さなWMHのクラスターを同定する。
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