論文の概要: Weakly supervised segmentation of intracranial aneurysms using a novel 3D focal modulation UNet
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.03001v2
- Date: Wed, 20 Mar 2024 15:29:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-21 22:47:21.339820
- Title: Weakly supervised segmentation of intracranial aneurysms using a novel 3D focal modulation UNet
- Title(参考訳): 新規3次元焦点変調UNetを用いた頭蓋内大動脈瘤の弱制御セグメンテーション
- Authors: Amirhossein Rasoulian, Arash Harirpoush, Soorena Salari, Yiming Xiao,
- Abstract要約: 本稿では,新しい3次元焦点変調UNetであるFocalSegNetを提案する。
UIA検出では偽陽性率は0.21で感度は0.80であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.5106162890866905
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: Accurate identification and quantification of unruptured intracranial aneurysms (UIAs) is crucial for the risk assessment and treatment of this cerebrovascular disorder. Current 2D manual assessment on 3D magnetic resonance angiography (MRA) is suboptimal and time-consuming. In addition, one major issue in medical image segmentation is the need for large well-annotated data, which can be expensive to obtain. Techniques that mitigate this requirement, such as weakly supervised learning with coarse labels are highly desirable. In the paper, we propose FocalSegNet, a novel 3D focal modulation UNet, to detect an aneurysm and offer an initial, coarse segmentation of it from time-of-flight MRA image patches, which is further refined with a dense conditional random field (CRF) post-processing layer to produce a final segmentation map. We trained and evaluated our model on a public dataset, and in terms of UIA detection, our model showed a low false-positive rate of 0.21 and a high sensitivity of 0.80. For voxel-wise aneurysm segmentation, we achieved a Dice score of 0.68 and a 95% Hausdorff distance of ~0.95 mm, demonstrating its strong performance. We evaluated our algorithms against the state-of-the-art 3D Residual-UNet and Swin-UNETR, and illustrated the superior performance of our proposed FocalSegNet, highlighting the advantages of employing focal modulation for this task.
- Abstract(参考訳): 脳血管障害のリスク評価と治療には,未破裂脳動脈瘤(UIAs)の正確な同定と定量化が重要である。
3次元磁気共鳴血管造影(MRA)の2次元手技による評価は、最適であり、時間を要する。
さらに、医用画像のセグメンテーションにおける大きな問題は、高額な大量の注釈付きデータを必要とすることである。
粗いラベルを用いた弱教師付き学習など、この要件を緩和する技術は非常に望ましい。
本稿では,新しい3次元焦点変調UNetであるFocalSegNetを提案する。このFocalSegNetは,飛行時間MRA画像パッチから,大脳動脈瘤を検出し,その初期的,粗いセグメンテーションを提供し,さらに高密度条件付きランダムフィールド(CRF)後処理層で改良して最終セグメンテーションマップを生成する。
UIA検出では偽陽性率は0.21で感度は0.80であった。
Voxel-wise aneurysm segmentationではDiceスコアが0.68、Hausdorff距離が95%であった。
我々は、最先端の3D Residual-UNetとSwin-UNETRに対してアルゴリズムを評価し、提案したFocalSegNetの優れた性能を示し、このタスクに焦点変調を用いることの利点を強調した。
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