論文の概要: OpenQDC: Open Quantum Data Commons
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.19629v1
- Date: Fri, 29 Nov 2024 11:25:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-02 15:18:39.332137
- Title: OpenQDC: Open Quantum Data Commons
- Title(参考訳): OpenQDC: Open Quantum Data Commons
- Authors: Cristian Gabellini, Nikhil Shenoy, Stephan Thaler, Semih Canturk, Daniel McNeela, Dominique Beaini, Michael Bronstein, Prudencio Tossou,
- Abstract要約: 我々は、37のQMデータセットを単一のアクセス可能なリソースに統合するopenQDCパッケージを紹介します。
これらのデータセットは慎重に前処理され、MLIPトレーニングのために標準化され、有機化学に関連する幅広い化学的要素と相互作用をカバーしている。
OpenQDCには正規化と統合のためのツールが含まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.347149276713065
- License:
- Abstract: Machine Learning Interatomic Potentials (MLIPs) are a highly promising alternative to force-fields for molecular dynamics (MD) simulations, offering precise and rapid energy and force calculations. However, Quantum-Mechanical (QM) datasets, crucial for MLIPs, are fragmented across various repositories, hindering accessibility and model development. We introduce the openQDC package, consolidating 37 QM datasets from over 250 quantum methods and 400 million geometries into a single, accessible resource. These datasets are meticulously preprocessed, and standardized for MLIP training, covering a wide range of chemical elements and interactions relevant in organic chemistry. OpenQDC includes tools for normalization and integration, easily accessible via Python. Experiments with well-known architectures like SchNet, TorchMD-Net, and DimeNet reveal challenges for those architectures and constitute a leaderboard to accelerate benchmarking and guide novel algorithms development. Continuously adding datasets to OpenQDC will democratize QM dataset access, foster more collaboration and innovation, enhance MLIP development, and support their adoption in the MD field.
- Abstract(参考訳): 機械学習原子間ポテンシャル(MLIP)は、分子動力学(MD)シミュレーションのための力場に非常に有望な代替手段であり、精密で迅速なエネルギーと力の計算を提供する。
しかし、MLIPに不可欠なQuantum-Mechanical (QM)データセットは、さまざまなリポジトリで断片化されており、アクセシビリティやモデル開発を妨げる。
我々は、250以上の量子メソッドと4億のジオメトリから37のQMデータセットを単一のアクセス可能なリソースに統合するopenQDCパッケージを紹介します。
これらのデータセットは慎重に前処理され、MLIPトレーニングのために標準化され、有機化学に関連する幅広い化学的要素と相互作用をカバーしている。
OpenQDCには正規化と統合のためのツールが含まれている。
SchNet、TorchMD-Net、DimeNetといった有名なアーキテクチャの実験は、これらのアーキテクチャの課題を明らかにし、ベンチマークを加速し、新しいアルゴリズム開発を導くためのリーダーボードを構成する。
OpenQDCにデータセットを継続的に追加することで、QMデータセットアクセスの民主化、コラボレーションとイノベーションの向上、MLIP開発の向上、MD分野への導入のサポートが可能になる。
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