論文の概要: Generative Humanization for Therapeutic Antibodies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.04737v1
- Date: Fri, 06 Dec 2024 02:54:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-09 15:55:11.659861
- Title: Generative Humanization for Therapeutic Antibodies
- Title(参考訳): 治療用抗体の遺伝子的ヒト化
- Authors: Cade Gordon, Aniruddh Raghu, Hunter Elliott, Peyton Greenside,
- Abstract要約: 人間化(Humanization)は、免疫原性と呼ばれる1つの重大なリスクに対処するシーケンス最適化戦略である。
我々は,ヒト抗体データに基づいて訓練された言語モデルからヒト化変異をサンプリングする条件生成モデリングタスクとして,人間化を再編成する。
免疫原性リスクを低減し、治療特性を維持または改善した候補配列を得るために、抗原結合親和性などの治療特性のモデルを含むサンプリングプロセスについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.456125565993172
- License:
- Abstract: Antibody therapies have been employed to address some of today's most challenging diseases, but must meet many criteria during drug development before reaching a patient. Humanization is a sequence optimization strategy that addresses one critical risk called immunogenicity - a patient's immune response to the drug - by making an antibody more "human-like" in the absence of a predictive lab-based test for immunogenicity. However, existing humanization strategies generally yield very few humanized candidates, which may have degraded biophysical properties or decreased drug efficacy. Here, we re-frame humanization as a conditional generative modeling task, where humanizing mutations are sampled from a language model trained on human antibody data. We describe a sampling process that incorporates models of therapeutic attributes, such as antigen binding affinity, to obtain candidate sequences that have both reduced immunogenicity risk and maintained or improved therapeutic properties, allowing this algorithm to be readily embedded into an iterative antibody optimization campaign. We demonstrate in silico and in lab validation that in real therapeutic programs our generative humanization method produces diverse sets of antibodies that are both (1) highly-human and (2) have favorable therapeutic properties, such as improved binding to target antigens.
- Abstract(参考訳): 抗体療法は、今日の最も困難な疾患のいくつかに対処するために使われてきたが、患者に到達する前には、薬物開発中に多くの基準を満たす必要がある。
人格化(Humanization)とは、免疫原性(免疫原性)と呼ばれる1つの重要なリスクに対処するシーケンス最適化戦略である。
しかし、既存の人格化戦略は一般的に、生物物理学的特性の低下や薬物効力の低下など、非常に少ない人格化候補を生み出す。
そこで我々は,ヒト抗体データに基づいて訓練された言語モデルからヒト化変異をサンプリングする条件生成モデリングタスクとして,人文化を再構築した。
免疫原性リスクを低減し、治療特性を維持または改善した候補配列を得るために、抗原結合親和性などの治療特性のモデルを含むサンプリングプロセスを説明し、このアルゴリズムを反復的抗体最適化キャンペーンに簡単に組み込むことができるようにする。
実際の治療プログラムにおいて, 生成的ヒト化法は(1)高ヒト, (2)標的抗原への結合性の改善など, 好適な治療特性を有する多様な抗体群を産生することを示した。
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