論文の概要: Efficient MedSAMs: Segment Anything in Medical Images on Laptop
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.16085v1
- Date: Fri, 20 Dec 2024 17:33:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-23 16:22:55.212459
- Title: Efficient MedSAMs: Segment Anything in Medical Images on Laptop
- Title(参考訳): 効率的なMedSAM: ラップトップ上の医療画像のセグメンテーション
- Authors: Jun Ma, Feifei Li, Sumin Kim, Reza Asakereh, Bao-Hiep Le, Dang-Khoa Nguyen-Vu, Alexander Pfefferle, Muxin Wei, Ruochen Gao, Donghang Lyu, Songxiao Yang, Lennart Purucker, Zdravko Marinov, Marius Staring, Haisheng Lu, Thuy Thanh Dao, Xincheng Ye, Zhi Li, Gianluca Brugnara, Philipp Vollmuth, Martha Foltyn-Dumitru, Jaeyoung Cho, Mustafa Ahmed Mahmutoglu, Martin Bendszus, Irada Pflüger, Aditya Rastogi, Dong Ni, Xin Yang, Guang-Quan Zhou, Kaini Wang, Nicholas Heller, Nikolaos Papanikolopoulos, Christopher Weight, Yubing Tong, Jayaram K Udupa, Cahill J. Patrick, Yaqi Wang, Yifan Zhang, Francisco Contijoch, Elliot McVeigh, Xin Ye, Shucheng He, Robert Haase, Thomas Pinetz, Alexander Radbruch, Inga Krause, Erich Kobler, Jian He, Yucheng Tang, Haichun Yang, Yuankai Huo, Gongning Luo, Kaisar Kushibar, Jandos Amankulov, Dias Toleshbayev, Amangeldi Mukhamejan, Jan Egger, Antonio Pepe, Christina Gsaxner, Gijs Luijten, Shohei Fujita, Tomohiro Kikuchi, Benedikt Wiestler, Jan S. Kirschke, Ezequiel de la Rosa, Federico Bolelli, Luca Lumetti, Costantino Grana, Kunpeng Xie, Guomin Wu, Behrus Puladi, Carlos Martín-Isla, Karim Lekadir, Victor M. Campello, Wei Shao, Wayne Brisbane, Hongxu Jiang, Hao Wei, Wu Yuan, Shuangle Li, Yuyin Zhou, Bo Wang,
- Abstract要約: 我々は,迅速な医用画像のセグメンテーションに特化した初の国際コンペを組織した。
トップチームは軽量なセグメンテーション基盤モデルを開発し、効率的な推論パイプラインを実装した。
最高のパフォーマンスのアルゴリズムは、臨床導入を促進するために、ユーザフレンドリーなインターフェースを備えたオープンソースソフトウェアに組み込まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 69.28565867103542
- License:
- Abstract: Promptable segmentation foundation models have emerged as a transformative approach to addressing the diverse needs in medical images, but most existing models require expensive computing, posing a big barrier to their adoption in clinical practice. In this work, we organized the first international competition dedicated to promptable medical image segmentation, featuring a large-scale dataset spanning nine common imaging modalities from over 20 different institutions. The top teams developed lightweight segmentation foundation models and implemented an efficient inference pipeline that substantially reduced computational requirements while maintaining state-of-the-art segmentation accuracy. Moreover, the post-challenge phase advanced the algorithms through the design of performance booster and reproducibility tasks, resulting in improved algorithms and validated reproducibility of the winning solution. Furthermore, the best-performing algorithms have been incorporated into the open-source software with a user-friendly interface to facilitate clinical adoption. The data and code are publicly available to foster the further development of medical image segmentation foundation models and pave the way for impactful real-world applications.
- Abstract(参考訳): 将来的なセグメンテーション基盤モデルは、医療画像の多様なニーズに対応するための変革的アプローチとして現れてきたが、既存のモデルの多くは高価なコンピューティングを必要としており、臨床実践における彼らの採用に大きな障壁となっている。
本研究では,20以上の施設の9つの一般的な画像モダリティにまたがる大規模データセットを特徴とする,医用画像セグメンテーションのための初の国際コンペティションを組織した。
トップチームは軽量セグメンテーション基礎モデルを開発し、最先端セグメンテーションの精度を維持しながら、計算要求を大幅に削減する効率的な推論パイプラインを実装した。
さらに, 性能向上器と再現性タスクを設計し, アルゴリズムを改良し, 勝利解の再現性を検証した。
さらに、最良のパフォーマンスのアルゴリズムがオープンソースソフトウェアにユーザフレンドリなインターフェースで組み込まれ、臨床応用が容易になっている。
データとコードは、医療画像セグメンテーション基盤モデルのさらなる開発を促進するために公開されており、実世界の影響力のある応用の道を開くことができる。
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