論文の概要: From Pixels to Gigapixels: Bridging Local Inductive Bias and Long-Range Dependencies with Pixel-Mamba
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.16711v1
- Date: Sat, 21 Dec 2024 17:45:27 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-24 15:58:36.790222
- Title: From Pixels to Gigapixels: Bridging Local Inductive Bias and Long-Range Dependencies with Pixel-Mamba
- Title(参考訳): Pixelからギガピクセル:Pixel-Mambaによる局所誘導バイアスと長距離依存性のブリッジ
- Authors: Zhongwei Qiu, Hanqing Chao, Tiancheng Lin, Wanxing Chang, Zijiang Yang, Wenpei Jiao, Yixuan Shen, Yunshuo Zhang, Yelin Yang, Wenbin Liu, Hui Jiang, Yun Bian, Ke Yan, Dakai Jin, Le Lu,
- Abstract要約: ギガピクセルWSIを効率的に扱うように設計された新しいディープラーニングアーキテクチャであるPixel-Mambaを紹介する。
Pixel-Mambaは、畳み込みニューラルネットワークに似たトークンを徐々に拡大することで、局所的な誘導バイアスを取り入れている。
実験では、エンドツーエンドのWSI分析のための強力で効率的なフレームワークとして、Pixel-Mambaの有効性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.19372261506739
- License:
- Abstract: Histopathology plays a critical role in medical diagnostics, with whole slide images (WSIs) offering valuable insights that directly influence clinical decision-making. However, the large size and complexity of WSIs may pose significant challenges for deep learning models, in both computational efficiency and effective representation learning. In this work, we introduce Pixel-Mamba, a novel deep learning architecture designed to efficiently handle gigapixel WSIs. Pixel-Mamba leverages the Mamba module, a state-space model (SSM) with linear memory complexity, and incorporates local inductive biases through progressively expanding tokens, akin to convolutional neural networks. This enables Pixel-Mamba to hierarchically combine both local and global information while efficiently addressing computational challenges. Remarkably, Pixel-Mamba achieves or even surpasses the quantitative performance of state-of-the-art (SOTA) foundation models that were pretrained on millions of WSIs or WSI-text pairs, in a range of tumor staging and survival analysis tasks, {\bf even without requiring any pathology-specific pretraining}. Extensive experiments demonstrate the efficacy of Pixel-Mamba as a powerful and efficient framework for end-to-end WSI analysis.
- Abstract(参考訳): 病理組織学は、臨床診断において重要な役割を担い、スライド画像全体(WSI)は、臨床的意思決定に直接影響を及ぼす貴重な洞察を提供する。
しかし、WSIsの大規模化と複雑さは、計算効率と効率的な表現学習の両方において、ディープラーニングモデルに重大な課題をもたらす可能性がある。
本稿では,ギガピクセルWSIを効率的に処理できる新しいディープラーニングアーキテクチャであるPixel-Mambaを紹介する。
Pixel-Mambaは、線形メモリ複雑性を備えた状態空間モデル(SSM)であるMambaモジュールを活用し、トークンを徐々に拡張することで局所的な帰納バイアスを取り入れ、畳み込みニューラルネットワークに似ている。
これにより、Pixel-Mambaは、ローカル情報とグローバル情報の両方を階層的に組み合わせながら、効率的な計算課題に対処することができる。
注目すべきは、Pixel-Mambaは、数百万のWSIまたはWSI-textペアで事前トレーニングされた最先端(SOTA)基盤モデルの定量的パフォーマンスを、病理学固有の事前トレーニングを必要とせずに、様々な腫瘍ステージングおよび生存分析タスクで達成または超えることである。
大規模な実験は、エンドツーエンドのWSI分析のための強力で効率的なフレームワークとしてPixel-Mambaの有効性を示す。
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