論文の概要: PointVoxelFormer -- Reviving point cloud networks for 3D medical imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.17390v1
- Date: Mon, 23 Dec 2024 08:43:39 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-24 15:57:59.112279
- Title: PointVoxelFormer -- Reviving point cloud networks for 3D medical imaging
- Title(参考訳): PointVoxelFormer -- 3D医療画像のためのポイントクラウドネットワークの復活
- Authors: Mattias Paul Heinrich,
- Abstract要約: 点雲は、医療画像における体積データを表現するための非常に効率的な方法である。
それらの利点にもかかわらず、ポイントクラウドは、ボリューム3D CNNやビジョントランスフォーマーと比較して、医療画像においてまだ過小評価されている。
この研究は、ポイントワイズ演算と中間微分可能化と高密度局所化CNNを組み合わせたハイブリッドアプローチを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: Point clouds are a very efficient way to represent volumetric data in medical imaging. First, they do not occupy resources for empty spaces and therefore can avoid trade-offs between resolution and field-of-view for voxel-based 3D convolutional networks (CNNs) - leading to smaller and robust models. Second, they provide a modality agnostic representation of anatomical surfaces and shapes to avoid domain gaps for generic geometric models. Third, they remove identifiable patient-specific information and may increase privacy preservation when publicly sharing data. Despite their benefits, point clouds are still underexplored in medical imaging compared to volumetric 3D CNNs and vision transformers. To date both datasets and stringent studies on comparative strengths and weaknesses of methodological choices are missing. Interactions and information exchange of spatially close points - e.g. through k-nearest neighbour graphs in edge convolutions or point transformations - within points clouds are crucial for learning geometrically meaningful features but may incur computational bottlenecks. This work presents a hybrid approach that combines point-wise operations with intermediate differentiable rasterisation and dense localised CNNs. For deformable point cloud registration, we devise an early fusion scheme for coordinate features that joins both clouds within a common reference frame and is coupled with an inverse consistent, two-step alignment architecture. Our extensive experiments on three different datasets for segmentation and registration demonstrate that our method, PointVoxelFormer, enables very compact models that excel with threefold speed-ups, fivefold memory reduction and over 30% registration error reduction against edge convolutions and other state-of-the-art models in geometric deep learning.
- Abstract(参考訳): 点雲は、医療画像における体積データを表現するための非常に効率的な方法である。
まず、空き空間の資源を占有しないため、ボクセルベースの3D畳み込みネットワーク(CNN)の解像度と視野のトレードオフを避けることができる。
第二に、それらは一般的な幾何学モデルに対する領域ギャップを避けるために解剖学的表面と形状のモダリティ非依存表現を提供する。
第3に、特定可能な患者固有の情報を取り除き、データを公開する際のプライバシー保護を高める可能性がある。
それらの利点にもかかわらず、ポイントクラウドは、ボリューム3D CNNやビジョントランスフォーマーと比較して、医療画像においてまだ過小評価されている。
これまでに、データセットと厳密な研究の両方が、方法論的選択の強みと弱みを欠いている。
空間的に閉じた点の相互作用と情報交換(例えば、エッジ畳み込みや点変換におけるk-ネアレスト近傍グラフ)は、幾何学的に意味のある特徴を学ぶのに欠かせないが、計算のボトルネックを引き起こす可能性がある。
この研究は、ポイントワイズ演算と中間微分可能ラスタライゼーションと高密度局所化CNNを組み合わせたハイブリッドアプローチを提案する。
変形可能な点雲登録のために、我々は、共通参照フレーム内で両方の雲と結合し、逆一貫した2段階のアライメントアーキテクチャと結合する特徴をコーディネートするための早期融合スキームを考案する。
セグメンテーションと登録のための3つの異なるデータセットに関する広範な実験により、我々の手法であるPointVoxelFormerは、3倍のスピードアップ、5倍のメモリ削減、エッジ畳み込みに対する30%以上のレジスタエラー削減、および幾何学的深層学習における他の最先端モデルに対して、非常にコンパクトなモデルを可能にすることを示した。
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