論文の概要: Self-Calibrated Dual Contrasting for Annotation-Efficient Bacteria Raman Spectroscopy Clustering and Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.20060v1
- Date: Sat, 28 Dec 2024 07:27:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-31 16:01:49.132558
- Title: Self-Calibrated Dual Contrasting for Annotation-Efficient Bacteria Raman Spectroscopy Clustering and Classification
- Title(参考訳): アノテーション有効細菌ラマン分光クラスタリングと分類のための自己校正デュアルコントラスト法
- Authors: Haiming Yao, Wei Luo, Tao Zhou, Ang Gao, Xue Wang,
- Abstract要約: 本稿では,Ramanスペクトル認識のためのアノテーション効率の良い自己校正デュアルコントラスト(SCDC)法を提案する。
我々のコアモチベーションは、2つの異なる部分空間における2つの異なる視点からのスペクトルを表現することである。
差別的表現を得るために,2つの視点から2つのコントラスト学習手法を実装した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.586869210490628
- License:
- Abstract: Raman scattering is based on molecular vibration spectroscopy and provides a powerful technology for pathogenic bacteria diagnosis using the unique molecular fingerprint information of a substance. The integration of deep learning technology has significantly improved the efficiency and accuracy of intelligent Raman spectroscopy (RS) recognition. However, the current RS recognition methods based on deep neural networks still require the annotation of a large amount of spectral data, which is labor-intensive. This paper presents a novel annotation-efficient Self-Calibrated Dual Contrasting (SCDC) method for RS recognition that operates effectively with few or no annotation. Our core motivation is to represent the spectrum from two different perspectives in two distinct subspaces: embedding and category. The embedding perspective captures instance-level information, while the category perspective reflects category-level information. Accordingly, we have implemented a dual contrastive learning approach from two perspectives to obtain discriminative representations, which are applicable for Raman spectroscopy recognition under both unsupervised and semi-supervised learning conditions. Furthermore, a self-calibration mechanism is proposed to enhance robustness. Validation of the identification task on three large-scale bacterial Raman spectroscopy datasets demonstrates that our SCDC method achieves robust recognition performance with very few (5$\%$ or 10$\%$) or no annotations, highlighting the potential of the proposed method for biospectral identification in annotation-efficient clinical scenarios.
- Abstract(参考訳): ラマン散乱は分子振動分光に基づいており、物質の特異な分子指紋情報を用いて病原細菌の診断に強力な技術を提供する。
ディープラーニング技術の統合により、知的ラマン分光(RS)認識の効率と精度が大幅に向上した。
しかし、ディープニューラルネットワークに基づく現在のRS認識方法は、労働集約的な大量のスペクトルデータのアノテーションを必要とする。
本稿では,アノテーションをほとんどあるいは全く使用せずに効果的に動作するRS認識のための,アノテーション効率の良い自己校正デュアルコントラスト(SCDC)手法を提案する。
我々のコアモチベーションは、埋め込みと圏という2つの異なる部分空間における2つの異なる視点からのスペクトルを表現することである。
埋め込みパースペクティブはインスタンスレベルの情報をキャプチャし、カテゴリパースペクティブはカテゴリレベルの情報を反映する。
そこで本研究では,教師なし・半教師なしの学習条件下でのラマン分光認識に適用可能な識別的表現を得るために,二つの視点から二重コントラスト学習手法を実装した。
さらに、堅牢性を高めるために自己校正機構を提案する。
3つの大規模細菌ラマン分光データに対する同定タスクの検証により,SCDC法は非常に少ない (5$\%$または10$\%$) , あるいは無アノテーションで頑健な認識性能を達成できることが示され, アノテーション効率の良い臨床シナリオにおけるバイオスペクトル同定法の可能性が浮き彫りにされた。
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