論文の概要: Unified Guidance for Geometry-Conditioned Molecular Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.02526v1
- Date: Sun, 05 Jan 2025 12:58:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-07 17:05:45.668174
- Title: Unified Guidance for Geometry-Conditioned Molecular Generation
- Title(参考訳): 幾何構成分子生成のための統一誘導
- Authors: Sirine Ayadi, Leon Hetzel, Johanna Sommer, Fabian Theis, Stephan Günnemann,
- Abstract要約: 非条件拡散モデルの幾何学的ガイダンスを制御するためのフレームワークであるUniGuideを紹介する。
構造ベース,フラグメントベース,リガンドベースの薬物設計などの応用がUniGuideフレームワークでどのように構成されているかを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.94578826467316
- License:
- Abstract: Effectively designing molecular geometries is essential to advancing pharmaceutical innovations, a domain, which has experienced great attention through the success of generative models and, in particular, diffusion models. However, current molecular diffusion models are tailored towards a specific downstream task and lack adaptability. We introduce UniGuide, a framework for controlled geometric guidance of unconditional diffusion models that allows flexible conditioning during inference without the requirement of extra training or networks. We show how applications such as structure-based, fragment-based, and ligand-based drug design are formulated in the UniGuide framework and demonstrate on-par or superior performance compared to specialised models. Offering a more versatile approach, UniGuide has the potential to streamline the development of molecular generative models, allowing them to be readily used in diverse application scenarios.
- Abstract(参考訳): 分子ジオメトリーを効果的に設計することは、生成モデルの成功、特に拡散モデルの成功を通じて大きな注目を集めてきた、医薬革新の進展に不可欠である。
しかし、現在の分子拡散モデルは、特定の下流タスクに向けて調整され、適応性に欠ける。
余分なトレーニングやネットワークを必要とせずに、推論中にフレキシブルな条件付けを可能にする、無条件拡散モデルの幾何学的ガイダンス制御のためのフレームワークであるUniGuideを紹介する。
構造ベース, フラグメントベース, リガンドベースの薬物設計などの応用がUniGuideフレームワークでどのように構成されているかを示し, 特化モデルと比較して, オンパーまたは優れた性能を示す。
より汎用的なアプローチを提供することで、UniGuideは分子生成モデルの開発を効率化し、多様なアプリケーションシナリオで容易に利用できるようになる。
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