論文の概要: A Unified Framework for Foreground and Anonymization Area Segmentation in CT and MRI Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.04361v1
- Date: Wed, 08 Jan 2025 08:58:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-09 14:55:12.978106
- Title: A Unified Framework for Foreground and Anonymization Area Segmentation in CT and MRI Data
- Title(参考訳): CTおよびMRIデータにおける前景および匿名化領域分割のための統一フレームワーク
- Authors: Michal Nohel, Constantin Ulrich, Jonathan Suprijadi, Tassilo Wald, Klaus Maier-Hein,
- Abstract要約: 本研究では,3次元医用イメージングのための自己教師あり学習(SSL)のためのデータ前処理の課題に対処するオープンソースツールキットを提案する。
ツールキットは、データサンプリングを最適化し、トレーニング時間を短縮するために前景領域を指示するセグメンテーションネットワークと、匿名化された領域を識別するセグメンテーションネットワークとを含む。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.10218470587045973
- License:
- Abstract: This study presents an open-source toolkit to address critical challenges in preprocessing data for self-supervised learning (SSL) for 3D medical imaging, focusing on data privacy and computational efficiency. The toolkit comprises two main components: a segmentation network that delineates foreground regions to optimize data sampling and thus reduce training time, and a segmentation network that identifies anonymized regions, preventing erroneous supervision in reconstruction-based SSL methods. Experimental results demonstrate high robustness, with mean Dice scores exceeding 98.5 across all anonymization methods and surpassing 99.5 for foreground segmentation tasks, highlighting the efficacy of the toolkit in supporting SSL applications in 3D medical imaging for both CT and MRI images. The weights and code is available at https://github.com/MIC-DKFZ/Foreground-and-Anonymization-Area-Segmentation.
- Abstract(参考訳): 本研究では,データプライバシと計算効率に着目した3次元医用画像の自己教師あり学習(SSL)のためのデータ前処理における重要な課題に対処するオープンソースツールキットを提案する。
ツールキットは、データサンプリングを最適化し、トレーニング時間を短縮するために前景領域を指示するセグメンテーションネットワークと、匿名化された領域を識別するセグメンテーションネットワークと、再構成ベースのSSLメソッドの誤監視を防止するセグメンテーションネットワークとを含む。
実験の結果、Diceスコアはすべての匿名化手法で98.5を超え、前景のセグメンテーションタスクでは99.5を超えた。
重みとコードはhttps://github.com/MIC-DKFZ/Foreground-and-Anonymization-Area-Segmentationで入手できる。
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