論文の概要: A data-driven approach to discover and quantify systemic lupus erythematosus etiological heterogeneity from electronic health records
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.07206v1
- Date: Mon, 13 Jan 2025 11:00:31 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-14 14:21:07.605173
- Title: A data-driven approach to discover and quantify systemic lupus erythematosus etiological heterogeneity from electronic health records
- Title(参考訳): 電子健康記録からの全身性エリテマトーデスの病原性発見と定量化のためのデータ駆動的アプローチ
- Authors: Marco Barbero Mota, John M. Still, Jorge L. Gamboa, Eric V. Strobl, Charles M. Stein, Vivian K. Kawai, Thomas A. Lasko,
- Abstract要約: 全身性エリテマトーデス(Systemic lupus erythematosus, SLE)は、多くの症状を呈する複雑な疾患である。
マルチモーダル不完全なEHRデータから確率的独立情報源を発見するためのデータ駆動型手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.167173990365707
- License:
- Abstract: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex heterogeneous disease with many manifestational facets. We propose a data-driven approach to discover probabilistic independent sources from multimodal imperfect EHR data. These sources represent exogenous variables in the data generation process causal graph that estimate latent root causes of the presence of SLE in the health record. We objectively evaluated the sources against the original variables from which they were discovered by training supervised models to discriminate SLE from negative health records using a reduced set of labelled instances. We found 19 predictive sources with high clinical validity and whose EHR signatures define independent factors of SLE heterogeneity. Using the sources as input patient data representation enables models to provide with rich explanations that better capture the clinical reasons why a particular record is (not) an SLE case. Providers may be willing to trade patient-level interpretability for discrimination especially in challenging cases.
- Abstract(参考訳): 全身性エリテマトーデス(Systemic lupus erythematosus, SLE)は, 複雑な異種性疾患である。
マルチモーダル不完全なEHRデータから確率的独立情報源を発見するためのデータ駆動型手法を提案する。
これらのソースは、健康記録におけるSLEの存在の潜在根本原因を推定するデータ生成プロセス因果グラフにおける外因性変数を表す。
本研究は, ラベル付き事例の少ない例を用いて, SLEを負の健康記録から識別するための教師付きモデルを用いて, 元の変数に対して客観的に評価した。
臨床正当性が高く, EHRシグネチャがSLEの不均一性の独立因子を規定する19の予測源を見出した。
入力された患者データ表現としてソースを使用することで、特定のレコードが(SLEの場合ではない)臨床上の理由をよりよく捉えるためのリッチな説明をモデルに提供することができる。
プロバイダは、特に困難なケースにおいて、患者レベルの解釈可能性と差別を交換する意思があるかもしれない。
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