論文の概要: Few-Shot Adaptation of Training-Free Foundation Model for 3D Medical Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.09138v1
- Date: Wed, 15 Jan 2025 20:44:21 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-17 15:10:23.302454
- Title: Few-Shot Adaptation of Training-Free Foundation Model for 3D Medical Image Segmentation
- Title(参考訳): 3次元医用画像セグメンテーションのためのトレーニングフリー基礎モデルのFew-Shot適応
- Authors: Xingxin He, Yifan Hu, Zhaoye Zhou, Mohamed Jarraya, Fang Liu,
- Abstract要約: FATE-SAM (Few-shot Adaptation of Training-frEe SAM) は、3次元医用画像セグメンテーションに高度なセグメンテーションモデル2 (SAM2) を適用するために設計された新しい手法である。
FATE-SAMはSAM2の事前訓練されたモジュールを再組み立てし、少数のサポート例を活用する。
複数の医用画像データセット上でFATE-SAMを評価し、教師付き学習方法、ゼロショットSAMアプローチ、微調整医療SAM手法と比較した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.78725593323412
- License:
- Abstract: Vision foundation models have achieved remarkable progress across various image analysis tasks. In the image segmentation task, foundation models like the Segment Anything Model (SAM) enable generalizable zero-shot segmentation through user-provided prompts. However, SAM primarily trained on natural images, lacks the domain-specific expertise of medical imaging. This limitation poses challenges when applying SAM to medical image segmentation, including the need for extensive fine-tuning on specialized medical datasets and a dependency on manual prompts, which are both labor-intensive and require intervention from medical experts. This work introduces the Few-shot Adaptation of Training-frEe SAM (FATE-SAM), a novel method designed to adapt the advanced Segment Anything Model 2 (SAM2) for 3D medical image segmentation. FATE-SAM reassembles pre-trained modules of SAM2 to enable few-shot adaptation, leveraging a small number of support examples to capture anatomical knowledge and perform prompt-free segmentation, without requiring model fine-tuning. To handle the volumetric nature of medical images, we incorporate a Volumetric Consistency mechanism that enhances spatial coherence across 3D slices. We evaluate FATE-SAM on multiple medical imaging datasets and compare it with supervised learning methods, zero-shot SAM approaches, and fine-tuned medical SAM methods. Results show that FATE-SAM delivers robust and accurate segmentation while eliminating the need for large annotated datasets and expert intervention. FATE-SAM provides a practical, efficient solution for medical image segmentation, making it more accessible for clinical applications.
- Abstract(参考訳): 視覚基礎モデルは様々な画像解析タスクにおいて顕著な進歩を遂げた。
イメージセグメンテーションタスクでは、SAM(Segment Anything Model)のような基盤モデルは、ユーザが提供するプロンプトを通じて、一般化可能なゼロショットセグメンテーションを可能にする。
しかしSAMは主に自然画像に基づいて訓練されており、医用画像の領域固有の専門知識は欠如している。
この制限は、SAMを医療画像セグメンテーションに適用する際の課題であり、専門的な医療データセットの詳細な調整や、労働集約的で医療専門家の介入を必要とする手動プロンプトへの依存などである。
本研究は,3次元医用画像セグメンテーションに先進的なセグメンションモデル2(SAM2)を適応させる新しい手法であるFATE-SAMを導入する。
FATE-SAMはSAM2の事前訓練済みモジュールを再組み立てし、少数のサポート例を活用して解剖学的知識を取り込み、モデルの微調整を必要とせず、即時的なセグメンテーションを行う。
医用画像のボリューム特性に対処するため,3次元スライスにおける空間コヒーレンスを高めるボリューム一貫性機構を組み込んだ。
複数の医用画像データセット上でFATE-SAMを評価し、教師付き学習方法、ゼロショットSAMアプローチ、微調整医療SAM手法と比較した。
その結果、FATE-SAMは、大規模な注釈付きデータセットや専門家による介入を不要にしながら、堅牢で正確なセグメンテーションを提供することがわかった。
FATE-SAMは、医療画像セグメンテーションのための実用的で効率的なソリューションを提供する。
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