論文の概要: Leveraging Textual Anatomical Knowledge for Class-Imbalanced Semi-Supervised Multi-Organ Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.13470v1
- Date: Thu, 23 Jan 2025 08:40:54 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-24 15:58:09.497755
- Title: Leveraging Textual Anatomical Knowledge for Class-Imbalanced Semi-Supervised Multi-Organ Segmentation
- Title(参考訳): クラス不均衡セミスーパービジョンマルチオーガンセグメンテーションのためのテクスチャ解剖知識の活用
- Authors: Yuliang Gu, Weilun Tsao, Bo Du, Thierry Géraud, Yongchao Xu,
- Abstract要約: 3D画像に注釈をつけるには、相当な時間と専門知識が必要である。
臓器の複雑な解剖学的構造は、しばしば大きなクラス不均衡を引き起こす。
本稿では,テキスト解剖学的知識(TAK)をセグメンテーションモデルに統合する手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 29.70206595766246
- License:
- Abstract: Annotating 3D medical images demands substantial time and expertise, driving the adoption of semi-supervised learning (SSL) for segmentation tasks. However, the complex anatomical structures of organs often lead to significant class imbalances, posing major challenges for deploying SSL in real-world scenarios. Despite the availability of valuable prior information, such as inter-organ relative positions and organ shape priors, existing SSL methods have yet to fully leverage these insights. To address this gap, we propose a novel approach that integrates textual anatomical knowledge (TAK) into the segmentation model. Specifically, we use GPT-4o to generate textual descriptions of anatomical priors, which are then encoded using a CLIP-based model. These encoded priors are injected into the segmentation model as parameters of the segmentation head. Additionally, contrastive learning is employed to enhance the alignment between textual priors and visual features. Extensive experiments demonstrate the superior performance of our method, significantly surpassing state-of-the-art approaches. The source code will be available at: https://github.com/Lunn88/TAK-Semi.
- Abstract(参考訳): 3D医療画像の注釈付けには相当な時間と専門知識が必要であり、セグメンテーションタスクに半教師付き学習(SSL)を採用する。
しかしながら、臓器の複雑な解剖学的構造は、しばしば大きなクラス不均衡を引き起こし、現実世界のシナリオでSSLをデプロイする上で大きな課題を提起する。
組織間の相対位置やオルガン形状といった貴重な事前情報の提供にもかかわらず、既存のSSLメソッドはまだこれらの洞察を十分に活用していない。
そこで本研究では,テキスト解剖学的知識(TAK)をセグメンテーションモデルに統合する手法を提案する。
具体的には,GPT-4oを用いて解剖学的先行のテキスト記述を生成し,CLIPモデルを用いて符号化する。
これらの符号化された先行データは、セグメント化ヘッドのパラメータとしてセグメント化モデルに注入される。
さらに、テキストの先行と視覚的特徴の整合性を高めるために、コントラスト学習が用いられる。
大規模な実験により,本手法の優れた性能を示し,最先端手法をはるかに上回る結果を得た。
ソースコードは、https://github.com/Lunn88/TAK-Semi.comで入手できる。
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