論文の概要: Adaptive H&E-IHC information fusion staining framework based on feature extra
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.20156v1
- Date: Thu, 27 Feb 2025 14:55:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-28 14:58:47.984122
- Title: Adaptive H&E-IHC information fusion staining framework based on feature extra
- Title(参考訳): 特徴量に基づく適応型H&E-IHC情報融合染色フレームワーク
- Authors: Yifan Jia, Xingda Yu, Zhengyang Ji, Songning Lai, Yutao Yue,
- Abstract要約: 乳がんなどの疾患評価においてIHC染色は重要な役割を担っている。
生成モデルに基づくH&E-to-IHC変換は、IHC画像を得るための単純で費用対効果の高い方法を提供する。
ピクセル完全H&E-IHC基底対の欠如は、古典的なL1損失への挑戦である。
特徴抽出器に基づく適応情報強化カラー化フレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.5242869847419834
- License:
- Abstract: Immunohistochemistry (IHC) staining plays a significant role in the evaluation of diseases such as breast cancer. The H&E-to-IHC transformation based on generative models provides a simple and cost-effective method for obtaining IHC images. Although previous models can perform digital coloring well, they still suffer from (i) coloring only through the pixel features that are not prominent in HE, which is easy to cause information loss in the coloring process; (ii) The lack of pixel-perfect H&E-IHC groundtruth pairs poses a challenge to the classical L1 loss.To address the above challenges, we propose an adaptive information enhanced coloring framework based on feature extractors. We first propose the VMFE module to effectively extract the color information features using multi-scale feature extraction and wavelet transform convolution, while combining the shared decoder for feature fusion. The high-performance dual feature extractor of H&E-IHC is trained by contrastive learning, which can effectively perform feature alignment of HE-IHC in high latitude space. At the same time, the trained feature encoder is used to enhance the features and adaptively adjust the loss in the HE section staining process to solve the problems related to unclear and asymmetric information. We have tested on different datasets and achieved excellent performance.Our code is available at https://github.com/babyinsunshine/CEFF
- Abstract(参考訳): 乳がんなどの疾患評価において免疫組織化学(IHC)染色は重要な役割を担っている。
生成モデルに基づくH&E-to-IHC変換は、IHC画像を得るための単純で費用対効果の高い方法を提供する。
従来のモデルはデジタルカラー化をうまく実現できたが、それでも苦しむ。
(i)色付けは、色付け過程において情報損失を生じやすく、HEで顕著でない画素特徴のみを通して行う。
(II) 画素完全H&E-IHC基底構造対の欠如は古典的なL1損失を招き, 上記の課題に対処するため, 特徴抽出器に基づく適応情報強化カラー化フレームワークを提案する。
まず,マルチスケールの特徴抽出とウェーブレット変換の畳み込みを用いて,特徴融合のための共有デコーダを組み合わせることで,色情報の特徴を効果的に抽出するVMFEモジュールを提案する。
H&E-IHCの高性能デュアル特徴抽出器は、高緯度空間におけるHE-IHCの特徴アライメントを効果的に行うことができるコントラスト学習によって訓練される。
同時に、訓練された特徴エンコーダを用いて特徴を高め、HE部染色工程の損失を適応的に調整し、不明瞭かつ非対称な情報に関連する問題を解決する。
私たちのコードはhttps://github.com/babyinsunshine/CEFFで公開されています。
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