論文の概要: Learning Surrogate Equations for the Analysis of an Agent-Based Cancer Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.01718v1
- Date: Mon, 03 Mar 2025 16:33:27 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-05 19:14:11.802269
- Title: Learning Surrogate Equations for the Analysis of an Agent-Based Cancer Model
- Title(参考訳): エージェントベース癌モデル解析のための代理方程式の学習
- Authors: Kevin Burrage, Pamela Burrage, Justin N. Kreikemeyer, Adelinde M. Uhrmacher, Hasitha N. Weerasinghe,
- Abstract要約: がん細胞と免疫細胞との競合を調べるために、6つの異なるシナリオを実行しました。
次に、結合方程式学習を用いて、各シナリオに対する集団ベースの反応モデルを構築する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.31457219084519
- License:
- Abstract: In this paper, we adapt a two species agent-based cancer model that describes the interaction between cancer cells and healthy cells on a uniform grid to include the interaction with a third species -- namely immune cells. We run six different scenarios to explore the competition between cancer and immune cells and the initial concentration of the immune cells on cancer dynamics. We then use coupled equation learning to construct a population-based reaction model for each scenario. We show how they can be unified into a single surrogate population-based reaction model, whose underlying three coupled ordinary differential equations are much easier to analyse than the original agent-based model. As an example, by finding the single steady state of the cancer concentration, we are able to find a linear relationship between this concentration and the initial concentration of the immune cells. This then enables us to estimate suitable values for the competition and initial concentration to reduce the cancer substantially without performing additional complex and expensive simulations from an agent-based stochastic model. The work shows the importance of performing equation learning from agent-based stochastic data for gaining key insights about the behaviour of complex cellular dynamics.
- Abstract(参考訳): 本稿では,がん細胞と健全な細胞との相互作用を均一な格子上に記述し,第3種,すなわち免疫細胞との相互作用を含む2種類のがんモデルを適用する。
がん細胞と免疫細胞との競合と、がんの動態に対する免疫細胞の初期濃度を調べるために、6つの異なるシナリオを実行します。
次に、結合方程式学習を用いて、各シナリオに対する集団ベースの反応モデルを構築する。
そこで本研究では, 従来のエージェントモデルよりも, 3つの結合常微分方程式を解析し易い単一代理集団に基づく反応モデルに統一する方法について述べる。
例えば、がん濃度の1つの定常状態を見つけることで、この濃度と免疫細胞の初期濃度との線形関係を見出すことができる。
これにより, エージェントベース確率モデルから, 複雑で高価なシミュレーションを行うことなく, 競合と初期濃度の適切な値を推定し, がんを著しく低減することができる。
この研究は、複雑な細胞力学の振る舞いに関する重要な洞察を得るために、エージェントベースの確率データから方程式学習を実行することの重要性を示す。
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