論文の概要: Leveraging Spatial Context for Positive Pair Sampling in Histopathology Image Representation Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.05170v2
- Date: Mon, 21 Jul 2025 05:36:36 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-22 18:47:38.863717
- Title: Leveraging Spatial Context for Positive Pair Sampling in Histopathology Image Representation Learning
- Title(参考訳): 病理画像表現学習における肯定的ペアサンプリングのための空間文脈の活用
- Authors: Willmer Rafell Quinones Robles, Sakonporn Noree, Young Sin Ko, Bryan Wong, Jongwoo Kim, Mun Yong Yi,
- Abstract要約: 複数のインスタンス学習と自己教師型学習が、従来のアノテーションベースの手法に代わる有望な代替手段として登場した。
本稿では,空間に隣接したパッチの形態的コヒーレンスを活用することでSSLを強化する空間文脈駆動型正対サンプリング戦略を提案する。
本手法は,Barlow Twins,BYOL,VICReg,DINOv2など,既存のSSLフレームワークと互換性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.0451307225357427
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep learning has shown strong potential in cancer classification from whole-slide images (WSIs), but the need for extensive expert annotations often limits its success. Annotation-free approaches, such as multiple instance learning (MIL) and self-supervised learning (SSL), have emerged as promising alternatives to traditional annotation-based methods. However, conventional SSL methods typically rely on synthetic data augmentations, which may fail to capture the spatial structure critical to histopathology. In this work, we propose a spatial context-driven positive pair sampling strategy that enhances SSL by leveraging the morphological coherence of spatially adjacent patches within WSIs. Our method is modular and compatible with established joint embedding SSL frameworks, including Barlow Twins, BYOL, VICReg, and DINOv2. We evaluate its effectiveness on both slide-level classification using MIL and patch-level linear probing. Experiments across four datasets demonstrate consistent performance improvements, with accuracy gains of 5\% to 10\% compared to standard augmentation-based sampling. These findings highlight the value of spatial context in improving representation learning for computational pathology and provide a biologically meaningful enhancement for pretraining models in annotation-limited settings. The code is available at https://anonymous.4open.science/r/contextual-pairs-E72F/.
- Abstract(参考訳): 深層学習は、全スライド画像(WSI)からがんの分類に強い可能性を示しているが、広範な専門家のアノテーションの必要性は、しばしばその成功を妨げている。
複数のインスタンス学習(MIL)や自己教師付き学習(SSL)といったアノテーションなしのアプローチが、従来のアノテーションベースの手法に代わる有望な代替手段として登場した。
しかし、従来のSSL法は一般的に人工的なデータ拡張に依存しており、それは病理学上重要な空間構造を捉えるのに失敗する可能性がある。
本稿では,WSI 内の空間隣接パッチの形態的コヒーレンスを利用して,SSL を強化する空間文脈駆動型正対サンプリング戦略を提案する。
本手法は,Barlow Twins,BYOL,VICReg,DINOv2など,既存のSSLフレームワークと互換性がある。
MILとパッチレベルの線形探索によるスライドレベル分類の有効性を評価する。
4つのデータセットにわたる実験では、標準的な拡張ベースのサンプリングと比較して、精度が5\%から10\%向上した、一貫したパフォーマンス改善が示されている。
これらの知見は,計算病理学における表現学習の改善における空間的文脈の価値を強調し,アノテーションに制限された環境下での事前学習モデルに対する生物学的に有意義な強化を提供する。
コードはhttps://anonymous.4open.science/r/contextual-pairs-E72F/で公開されている。
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