論文の概要: Enhancing Deep Learning Based Structured Illumination Microscopy Reconstruction with Light Field Awareness
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.11640v1
- Date: Fri, 14 Mar 2025 17:56:49 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-17 13:06:15.996771
- Title: Enhancing Deep Learning Based Structured Illumination Microscopy Reconstruction with Light Field Awareness
- Title(参考訳): 光場認識による深層学習による構造イルミネーション顕微鏡再構成の強化
- Authors: Long-Kun Shan, Ze-Hao Wang, Tong-Tian Weng, Xiang-Dong Chen, Fang-Wen Sun,
- Abstract要約: 本稿では,データ分散シフトによる誤差を補正するために,実際の光場を直接推定するAL-SIM(Awareness-of-Light-field SIM)再構成手法を提案する。
本手法は,正規化ルート平均二乗誤差(NRMSE)を7%低減し,再建アーチファクトを大幅に低減することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.2529846338268475
- License:
- Abstract: Structured illumination microscopy (SIM) is a pivotal technique for dynamic subcellular imaging in live cells. Conventional SIM reconstruction algorithms depend on accurately estimating the illumination pattern and can introduce artefacts when this estimation is imprecise. Although recent deep learning-based SIM reconstruction methods have improved speed, accuracy, and robustness, they often struggle with out-of-distribution data. To address this limitation, we propose an Awareness-of-Light-field SIM (AL-SIM) reconstruction approach that directly estimates the actual light field to correct for errors arising from data distribution shifts. Through comprehensive experiments on both simulated filament structures and live BSC1 cells, our method demonstrates a 7% reduction in the normalized root mean square error (NRMSE) and substantially lowers reconstruction artefacts. By minimizing these artefacts and improving overall accuracy, AL-SIM broadens the applicability of SIM for complex biological systems.
- Abstract(参考訳): 構造照明顕微鏡(Structured LED microscopy, SIM)は、生体細胞における動的細胞内イメージングのための重要な技術である。
従来のSIM再構成アルゴリズムは、照明パターンを正確に推定することに依存しており、この推定が不正確である場合にアーチファクトを導入することができる。
近年の深層学習に基づくSIM再構成手法は, 速度, 精度, 堅牢性を向上しているが, アウト・オブ・ディストリビューションデータに苦慮することが多い。
この制限に対処するため,データ分散シフトによる誤差を補正するために,実際の光場を直接推定するアウェアネス・オブ・ライトフィールドSIM (AL-SIM) 再構成手法を提案する。
シミュレーションフィラメント構造と生きたBSC1細胞の両方に関する包括的な実験により, 正規化根平均二乗誤差(NRMSE)が7%減少し, 再建アーチファクトを著しく低下させることを示した。
これらのアーティファクトを最小化し、全体的な精度を向上させることで、AL-SIMは複雑な生物学的システムに対するSIMの適用範囲を広げる。
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