論文の概要: Sparseformer: a Transferable Transformer with Multi-granularity Token Sparsification for Medical Time Series Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.15578v1
- Date: Wed, 19 Mar 2025 13:22:42 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-21 19:01:15.745770
- Title: Sparseformer: a Transferable Transformer with Multi-granularity Token Sparsification for Medical Time Series Classification
- Title(参考訳): Sparseformer:医療時系列分類のための多粒度トークンスカラー化トランスフォーマ
- Authors: Jiexia Ye, Weiqi Zhang, Ziyue Li, Jia Li, Fugee Tsung,
- Abstract要約: MedTS分類用に特別に設計された変換器であるSparseformerを紹介する。
本稿では,大域的モデリングとトークン圧縮を実現するための,スパーストークンベースのデュアルアテンション機構を提案する。
我々のモデルは、教師あり学習下で7つの医療データセットで12のベースラインを上回ります。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.47662257105448
- License:
- Abstract: Medical time series (MedTS) classification is crucial for improved diagnosis in healthcare, and yet it is challenging due to the varying granularity of patterns, intricate inter-channel correlation, information redundancy, and label scarcity. While existing transformer-based models have shown promise in time series analysis, they mainly focus on forecasting and fail to fully exploit the distinctive characteristics of MedTS data. In this paper, we introduce Sparseformer, a transformer specifically designed for MedTS classification. We propose a sparse token-based dual-attention mechanism that enables global modeling and token compression, allowing dynamic focus on the most informative tokens while distilling redundant features. This mechanism is then applied to the multi-granularity, cross-channel encoding of medical signals, capturing intra- and inter-granularity correlations and inter-channel connections. The sparsification design allows our model to handle heterogeneous inputs of varying lengths and channels directly. Further, we introduce an adaptive label encoder to address label space misalignment across datasets, equipping our model with cross-dataset transferability to alleviate the medical label scarcity issue. Our model outperforms 12 baselines across seven medical datasets under supervised learning. In the few-shot learning experiments, our model also achieves superior average results. In addition, the in-domain and cross-domain experiments among three diagnostic scenarios demonstrate our model's zero-shot learning capability. Collectively, these findings underscore the robustness and transferability of our model in various medical applications.
- Abstract(参考訳): MedTS分類は、医療における診断の改善に不可欠であるが、パターンの粒度、複雑なチャネル間相関、情報冗長性、ラベル不足などにより困難である。
既存のトランスフォーマーベースのモデルは時系列解析において有望であるが、主に予測に重点を置いており、MedTSデータの特徴を十分に活用できない。
本稿では,MedTS分類に特化して設計された変換器であるSparseformerを紹介する。
本稿では,グローバルなモデリングとトークン圧縮を実現し,冗長な特徴を蒸留しながら最も情報性の高いトークンに動的に焦点をあてる,スパーストークンベースのデュアルアテンション機構を提案する。
このメカニズムは、医療信号の多粒性、チャネル間符号化に適用され、粒内およびチャネル間相関とチャネル間接続をキャプチャする。
このスペーシフィケーション設計により、異なる長さとチャネルの異種入力を直接処理できる。
さらに,データセット間のラベル空間の不一致に対処する適応ラベルエンコーダを導入し,医療ラベルの不足を軽減すべく,データセット間転送性を備えたモデルを提案する。
我々のモデルは、教師あり学習下で7つの医療データセットで12のベースラインを上回ります。
数ショットの学習実験では,本モデルがより優れた平均結果を得る。
さらに、3つの診断シナリオにおけるドメイン内およびドメイン間実験は、モデルのゼロショット学習能力を実証する。
以上より, これらの知見は, 各種医療応用におけるモデルの堅牢性と伝達性を明らかにするものである。
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