論文の概要: A Multi-Stage Auto-Context Deep Learning Framework for Tissue and Nuclei Segmentation and Classification in H&E-Stained Histological Images of Advanced Melanoma
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.23958v1
- Date: Mon, 31 Mar 2025 11:15:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-01 14:35:08.314075
- Title: A Multi-Stage Auto-Context Deep Learning Framework for Tissue and Nuclei Segmentation and Classification in H&E-Stained Histological Images of Advanced Melanoma
- Title(参考訳): 進行黒色腫のH&E染色組織像における組織・核分離・分類のための多段階自動深層学習フレームワーク
- Authors: Nima Torbati, Anastasia Meshcheryakova, Diana Mechtcheriakova, Amirreza Mahbod,
- Abstract要約: メラノーマは皮膚がんで最も致命的な形態であり、世界中で発生率が高くなっている。
組織情報と核情報を組み合わせた多段階深層学習手法を提案する。
我々のアプローチはPUMAチャレンジで2位と1位を獲得した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.774770116605161
- License:
- Abstract: Melanoma is the most lethal form of skin cancer, with an increasing incidence rate worldwide. Analyzing histological images of melanoma by localizing and classifying tissues and cell nuclei is considered the gold standard method for diagnosis and treatment options for patients. While many computerized approaches have been proposed for automatic analysis, most perform tissue-based analysis and nuclei (cell)-based analysis as separate tasks, which might be suboptimal. In this work, using the PUMA challenge dataset, we proposed a novel multi-stage deep learning approach by combining tissue and nuclei information in a unified framework based on the auto-context concept to perform segmentation and classification in histological images of melanoma. Through pre-training and further post-processing, our approach achieved second and first place rankings in the PUMA challenge, with average micro Dice tissue score and summed nuclei F1-score of 73.40% for Track 1 and 63.48% for Track 2, respectively. Our implementation for training and testing is available at: https://github.com/NimaTorbati/PumaSubmit
- Abstract(参考訳): メラノーマは皮膚がんで最も致命的な形態であり、世界中で発生率が高くなっている。
組織および細胞核の局在・分別によるメラノーマの組織像の解析は,患者に対する診断・治療のための金の標準的方法であると考えられる。
多くのコンピュータ化されたアプローチが自動解析のために提案されているが、多くの場合、組織に基づく分析と核(細胞)に基づく分析は、最適ではないかもしれない別のタスクとして実行されている。
本研究では, PUMAチャレンジデータセットを用いて, 組織情報と核情報を統合した多段階深層学習手法を提案し, メラノーマの組織像におけるセグメンテーションと分類を行う。
前処理と後処理を併用し,PUMAチャレンジでは平均マイクロディス組織スコアと総核F1スコアが73.40%,トラック2では63.48%で2位,第1位にランクインした。
トレーニングとテストのための実装は、https://github.com/NimaTorbati/PumaSubmit.comで公開しています。
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