論文の概要: A Solid-State Nanopore Signal Generator for Training Machine Learning Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.05466v1
- Date: Mon, 07 Apr 2025 19:56:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-09 13:29:02.250494
- Title: A Solid-State Nanopore Signal Generator for Training Machine Learning Models
- Title(参考訳): 機械学習モデルの訓練のための固体ナノ孔信号発生装置
- Authors: Jaise Johnson, Chinmayi R Galigekere, Manoj M Varma,
- Abstract要約: 本稿では,機械学習応用のための広範囲な合成データセットを生成可能なナノ孔信号生成装置を提案する。
ディープラーニングモデルをトレーニングして、生信号から直接転位イベントを検出し、最小限の偽陽性で99%以上の真のイベント検出を達成します。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Translocation event detection from raw nanopore current signals is a fundamental step in nanopore signal analysis. Traditional data analysis methods rely on user-defined parameters to extract event information, making the interpretation of experimental results sensitive to parameter choice. While Machine Learning (ML) has seen widespread adoption across various scientific fields, its potential remains underexplored in solid-state nanopore research. In this work, we introduce a nanopore signal generator capable of producing extensive synthetic datasets for machine learning applications and benchmarking nanopore signal analysis platforms. Using this generator, we train deep learning models to detect translocation events directly from raw signals, achieving over 99% true event detection with minimal false positives.
- Abstract(参考訳): 生ナノ細孔電流信号からの転位事象検出は、ナノ細孔信号解析の基本的なステップである。
従来のデータ分析手法は、パラメータの選択に敏感な実験結果の解釈を、ユーザ定義のパラメータに頼ってイベント情報を抽出する。
機械学習(ML)は様々な科学分野に広く採用されているが、そのポテンシャルは固体ナノ孔の研究において過小評価されている。
本研究では,機械学習応用のための広範な合成データセットを作成し,ナノ孔信号解析プラットフォームをベンチマークするナノ孔信号生成装置を提案する。
このジェネレータを用いて深層学習モデルを用いて、生信号から直接転位イベントを検出し、最小限の偽陽性で99%以上の真の事象検出を達成する。
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