論文の概要: Bayesian dynamic borrowing considering semantic similarity between outcomes for disproportionality analysis in FAERS
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.12052v1
- Date: Wed, 16 Apr 2025 13:06:24 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-17 14:40:01.728168
- Title: Bayesian dynamic borrowing considering semantic similarity between outcomes for disproportionality analysis in FAERS
- Title(参考訳): FAERSにおける不均等性分析の結果間の意味的類似性を考慮したベイズ動的借入
- Authors: François Haguinet, Jeffery L Painter, Gregory E Powell, Andrea Callegaro, Andrew Bate,
- Abstract要約: 本稿では,自然報告システム(SRS)における有害事象(AE)の定量的同定を強化するため,ベイズ動的借入(BDB)アプローチを提案する。
この方法はベイズ階層モデルに先立って頑健なメタ分析予測(MAP)を組み込み、意味的類似度尺度(SSM)を組み込む。
これらの知見は、従来のDPA法に対するスケーラブルでコンテキスト対応な拡張として、SSMインフォームド・ベイズ借用が有効である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: We present a Bayesian dynamic borrowing (BDB) approach to enhance the quantitative identification of adverse events (AEs) in spontaneous reporting systems (SRSs). The method embeds a robust meta-analytic predictive (MAP) prior within a Bayesian hierarchical model and incorporates semantic similarity measures (SSMs) to enable weighted information sharing from MedDRA Preferred Terms (PTs) that are clinical similar to the target PT. This continuous similarity-based borrowing addresses limitation of rigid hierarchical grouping in current disproportionality analysis (DPA). Using data from the FDA Adverse Event Reporting System (FAERS) between 2015 and 2019, we evalute this approach - termed IC SSM - against standard Information Component (IC) analysis and IC with borrowing at the MedDRA high-level group term (HLGT) level. A novel references set (PVLens), derived from FDA product label updates, enabled prospective evaluation of method performance in identifying AEs prior to official labeling. The IC SSM approach demonstrated improved sensitivity compared to both traditional IC and HLGT-based borrowing, with minor trade-offs in F1 scores and Youden's index. IC SSM consistently identified more true positives and detected signals over 5 months sooner than traditional IC. Despite a marginally lower aggregate Youden's index, IC SSM showed higher performance in the early post-marketing period, providing more stable and relevant estimates than HLGT-based borrowing and traditional IC. These findings support the use of SSM-informed Bayesian borrowing as a scalable and context-aware enhancement to traditional DPA methods. Future research should validate this approach across other datasets and explore additional similarity metrics and Bayesian inference strategies using case-level data.
- Abstract(参考訳): 本稿では,自然報告システム(SRS)における有害事象(AE)の定量的同定を強化するため,ベイズ動的借入(BDB)アプローチを提案する。
この方法はベイズ階層モデルに先立って頑健なメタ分析予測(MAP)を組み込み、意味的類似度尺度(SSM)を組み込んで、ターゲットPTと臨床的なMedDRA Preferred Terms(PT)からの重み付き情報共有を可能にする。
この連続的類似性に基づく借入は、現在の不均等性解析(DPA)における厳密な階層的グループ化の制限に対処する。
我々は,2015年から2019年までのFDA Adverse Event Reporting System(FAERS)のデータを用いて,標準情報成分分析(IC)と,MedDRAハイレベルグループ用語(HLGT)レベルでの借用によるICに対して,IC SSM(IC SSM)と呼ばれるこのアプローチを評価した。
FDA製品ラベル更新から派生した新しい参照セット(PVLens)は、公式なラベル付けの前にAEを識別する際のメソッドパフォーマンスの予測評価を可能にした。
IC SSMアプローチでは従来のICとHLGTベースの借入よりも感度が向上し,F1スコアとYouden指数は小さかった。
IC SSMは、従来のICよりも5ヶ月以上早く、より真の陽性と検出シグナルを一貫して同定した。
Youden's index はわずかに低かったが、IC SSM は発売後早期に高い性能を示し、HLGT ベースの借入や従来の IC よりも安定し、関連する見積もりを提供した。
これらの知見は、従来のDPA法に対するスケーラブルでコンテキスト対応な拡張として、SSMインフォームド・ベイズ借用が有効である。
今後の研究では、このアプローチを他のデータセットにわたって検証し、ケースレベルのデータを使用して、さらなる類似度メトリクスとベイズ推論戦略を探求する必要がある。
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