論文の概要: Linear to Neural Networks Regression: QSPR of Drugs via Degree-Distance Indices
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.07821v1
- Date: Tue, 18 Mar 2025 20:03:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-22 23:32:14.392539
- Title: Linear to Neural Networks Regression: QSPR of Drugs via Degree-Distance Indices
- Title(参考訳): リニアからニューラルネットワークへの回帰:Dregree-Distance Indicesによる薬物のQSPR
- Authors: M. J. Nadjafi Arani, S. Sorgun, M. Mirzargar,
- Abstract要約: この研究は、予測精度を高めるために、トポロジカル指標と機械学習を統合するという革新的な視点を提供する。
この予測は、トポロジカルな指標と物理的性質の間の信頼性の高い関係を確立することで、化学者が分子の挙動に関する予備的な洞察を得ることができることを説明できるかもしれない。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: This study conducts a Quantitative Structure Property Relationship (QSPR) analysis to explore the correlation between the physical properties of drug molecules and their topological indices using machine learning techniques. While prior studies in drug design have focused on degree-based topological indices, this work analyzes a dataset of 166 drug molecules by computing degree-distance-based topological indices, incorporating vertex-edge weightings with respect to different six atomic properties (atomic number, atomic radius, atomic mass, density, electronegativity, ionization). Both linear models (Linear Regression, Lasso, and Ridge Regression) and nonlinear approaches (Random Forest, XGBoost, and Neural Networks) were employed to predict molecular properties. The results demonstrate the effectiveness of these indices in predicting specific physicochemical properties and underscore the practical relevance of computational methods in molecular property estimation. The study provides an innovative perspective on integrating topological indices with machine learning to enhance predictive accuracy, highlighting their potential application in drug discovery and development processes. This predictive may also explain that establishing a reliable relationship between topological indices and physical properties enables chemists to gain preliminary insights into molecular behavior before conducting experimental analyses, thereby optimizing resource utilization in cheminformatics research.
- Abstract(参考訳): 本研究は, 薬物分子の物理特性とそれらのトポロジカル指標との相関関係を機械学習技術を用いて検討するために, 定量的構造特性関係(QSPR)解析を行う。
薬物設計における以前の研究は、次数に基づくトポロジカル指標に焦点が当てられていたが、この研究は、原子番号、原子半径、原子質量、密度、電子陰性度、イオン化)の異なる6つの原子特性(原子番号、原子半径、原子質量、密度、電子陰性度、イオン化)に関して頂点重み付けを組み込んだ、次数に基づくトポロジカル指標の計算によって166個の薬物分子のデータセットを分析した。
線形モデル (Linear Regression, Lasso, Ridge Regression) と非線形アプローチ (Random Forest, XGBoost, Neural Networks) の両方を用いて分子特性の予測を行った。
その結果, 物理化学的特性の予測におけるこれらの指標の有効性が示され, 分子特性推定における計算手法の実際的妥当性が明らかにされた。
この研究は、予測精度を高めるために、トポロジカル指標と機械学習の統合に関する革新的な視点を提供し、薬物発見と開発プロセスにおけるその可能性を強調している。
この予測は、トポロジカル指標と物理特性との信頼性の高い関係を確立することで、化学者が実験的な分析を行う前に分子の挙動に関する予備的な洞察を得ることができ、したがって化学情報学の研究における資源利用の最適化が可能であることも説明できる。
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