論文の概要: Learning Repetition-Invariant Representations for Polymer Informatics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.10726v1
- Date: Thu, 15 May 2025 22:05:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-19 14:36:13.667798
- Title: Learning Repetition-Invariant Representations for Polymer Informatics
- Title(参考訳): 高分子インフォマティクスにおける繰り返し不変表現の学習
- Authors: Yihan Zhu, Gang Liu, Eric Inae, Tengfei Luo, Meng Jiang,
- Abstract要約: グラフ反復不変性(GRIN)は,グラフ表現における繰り返し単位の数に不変なポリマー表現を学習するための新しい手法である。
GRINはグラフベースの最大スパンニングツリーアライメントと繰り返しユニット拡張を統合し、構造的な一貫性を確保する。
ホモポリマーとコポリマーのベンチマークで最先端のベースラインを上回り、安定で反復不変な表現を学習し、目に見えない大きさのポリマー鎖に効果的に一般化する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.45788515943579
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Polymers are large macromolecules composed of repeating structural units known as monomers and are widely applied in fields such as energy storage, construction, medicine, and aerospace. However, existing graph neural network methods, though effective for small molecules, only model the single unit of polymers and fail to produce consistent vector representations for the true polymer structure with varying numbers of units. To address this challenge, we introduce Graph Repetition Invariance (GRIN), a novel method to learn polymer representations that are invariant to the number of repeating units in their graph representations. GRIN integrates a graph-based maximum spanning tree alignment with repeat-unit augmentation to ensure structural consistency. We provide theoretical guarantees for repetition-invariance from both model and data perspectives, demonstrating that three repeating units are the minimal augmentation required for optimal invariant representation learning. GRIN outperforms state-of-the-art baselines on both homopolymer and copolymer benchmarks, learning stable, repetition-invariant representations that generalize effectively to polymer chains of unseen sizes.
- Abstract(参考訳): 高分子は単量体として知られる構造単位を繰り返す構造単位からなる大きな高分子であり、エネルギー貯蔵、建設、医療、航空宇宙などの分野に広く応用されている。
しかし、既存のグラフニューラルネットワークは小さな分子に対して有効であるが、ポリマーの単一単位をモデル化するだけで、単位数が異なる真のポリマー構造に対して一貫したベクトル表現を生成できない。
この課題に対処するために、グラフ表現における繰り返し単位の数に不変なポリマー表現を学習する新しい方法であるグラフ反復不変性(GRIN)を導入する。
GRINはグラフベースの最大スパンニングツリーアライメントと繰り返しユニット拡張を統合し、構造的な一貫性を確保する。
モデルとデータの観点からの反復不変性の理論的保証を行い、3つの繰り返し単位が最適な不変表現学習に必要な最小拡張であることを示す。
GRINは、ホモポリマーとコポリマーのベンチマークで最先端のベースラインを上回り、安定で反復不変な表現を学習し、目に見えない大きさのポリマー鎖に効果的に一般化する。
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