論文の概要: Understanding the Capabilities of Molecular Graph Neural Networks in Materials Science Through Multimodal Learning and Physical Context Encoding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.12137v1
- Date: Sat, 17 May 2025 20:42:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-20 14:57:11.059513
- Title: Understanding the Capabilities of Molecular Graph Neural Networks in Materials Science Through Multimodal Learning and Physical Context Encoding
- Title(参考訳): マルチモーダル学習と物理文脈符号化による材料科学における分子グラフニューラルネットワークの機能理解
- Authors: Can Polat, Hasan Kurban, Erchin Serpedin, Mustafa Kurban,
- Abstract要約: 分子グラフニューラルネットワーク(GNN)は、しばしばXYZベースの幾何学的表現にのみ焦点をあてる。
この研究は、IUPAC名、分子式、物理化学的性質、同義語などのテキスト記述子を統合するマルチモーダルフレームワークを導入している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.172419551358714
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Molecular graph neural networks (GNNs) often focus exclusively on XYZ-based geometric representations and thus overlook valuable chemical context available in public databases like PubChem. This work introduces a multimodal framework that integrates textual descriptors, such as IUPAC names, molecular formulas, physicochemical properties, and synonyms, alongside molecular graphs. A gated fusion mechanism balances geometric and textual features, allowing models to exploit complementary information. Experiments on benchmark datasets indicate that adding textual data yields notable improvements for certain electronic properties, while gains remain limited for others. Furthermore, the GNN architectures display similar performance patterns (improving and deteriorating on analogous targets), suggesting they learn comparable representations rather than distinctly different physical insights.
- Abstract(参考訳): 分子グラフニューラルネットワーク(GNN)は、しばしばXYZベースの幾何学的表現にのみ焦点を合わせ、PubChemのような公開データベースで利用可能な貴重な化学状況を見落としている。
この研究は、IUPAC名、分子式、物理化学的性質、同義語などのテキスト記述子を分子グラフとともに統合するマルチモーダルフレームワークを導入する。
ゲート融合機構は幾何学的特徴とテキスト的特徴のバランスをとり、モデルが相補的な情報を利用することを可能にする。
ベンチマークデータセットの実験では、テキストデータの追加は特定の電子特性に対して顕著な改善をもたらすが、利得は他のものに対しては制限されている。
さらに、GNNアーキテクチャは、類似したパフォーマンスパターン(類似のターゲットに対して改善と劣化)を示し、異なる物理的洞察よりも、同等の表現を学ぶことを示唆している。
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