論文の概要: Joint Denoising of Cryo-EM Projection Images using Polar Transformers

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.11283v1
• Date: Thu, 12 Jun 2025 20:41:38 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-06-16 17:50:49.577167
• Title: Joint Denoising of Cryo-EM Projection Images using Polar Transformers
• Title（参考訳）: 極変圧器を用いたCryo-EM投影画像の合成
• Authors: Joakim Andén, Justus Sagemüller,
• Abstract要約: 本稿では,Cryo-EM画像のクラスタリング,アライメント,デノイングを同時に行うことで,クラス平均化手法を拡張したトランスフォーマに基づくニューラルネットワークアーキテクチャを提案する。 その結果,SNRが0.03ドルで相対平均2乗誤差(MSE)のDNNを45%削減できることがわかった。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.10742675209112623
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Deep neural networks~(DNNs) have proven powerful for denoising, but they are ultimately of limited use in high-noise settings, such as for cryogenic electron microscopy~(cryo-EM) projection images. In this setting, however, datasets contain a large number of projections of the same molecule, each taken from a different viewing direction. This redundancy of information is useful in traditional denoising techniques known as class averaging methods, where images are clustered, aligned, and then averaged to reduce the noise level. We present a neural network architecture based on transformers that extends these class averaging methods by simultaneously clustering, aligning, and denoising cryo-EM images. Results on synthetic data show accurate denoising performance using this architecture, reducing the relative mean squared error (MSE) single-image DNNs by $45\%$ at a signal-to-noise (SNR) of $0.03$.
• Abstract（参考訳）: ディープ・ニューラル・ネットワーク~(DNN)はデノナイジングに強力であることが証明されているが、極端には極低温電子顕微鏡~(cryo-EM)プロジェクション画像のような高ノイズ設定に限られている。 しかし、この設定では、データセットには同じ分子の多数の投射が含まれており、それぞれが異なる観察方向から取られている。 この冗長性は、画像がクラスタ化され、アライメントされ、ノイズレベルを下げるために平均化される、クラス平均化(class averaging)と呼ばれる従来のデノーミング手法で有用である。 本稿では,Cryo-EM画像のクラスタリング,アライメント,デノイングを同時に行うことで,これらのクラス平均化手法を拡張したトランスフォーマに基づくニューラルネットワークアーキテクチャを提案する。 その結果,SNRが0.03ドルで相対平均2乗誤差(MSE)のDNNを45\%の値に削減した。

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