論文の概要: Pediatric Pancreas Segmentation from MRI Scans with Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.15908v1
- Date: Wed, 18 Jun 2025 22:59:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-23 19:00:04.877308
- Title: Pediatric Pancreas Segmentation from MRI Scans with Deep Learning
- Title(参考訳): 深層学習によるMRI画像からの小児膵分画の検討
- Authors: Elif Keles, Merve Yazol, Gorkem Durak, Ziliang Hong, Halil Ertugrul Aktas, Zheyuan Zhang, Linkai Peng, Onkar Susladkar, Necati Guzelyel, Oznur Leman Boyunaga, Cemal Yazici, Mark Lowe, Aliye Uc, Ulas Bagci,
- Abstract要約: PanSegNetは、MRIによる小児膵分画のディープラーニングアルゴリズムである。
ガジ大学における2~19歳児のMRI像84点を振り返って収集した。
PanSegNetは、健康状態と疾患のある州で専門家レベルのパフォーマンスを達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.22717394386384
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Objective: Our study aimed to evaluate and validate PanSegNet, a deep learning (DL) algorithm for pediatric pancreas segmentation on MRI in children with acute pancreatitis (AP), chronic pancreatitis (CP), and healthy controls. Methods: With IRB approval, we retrospectively collected 84 MRI scans (1.5T/3T Siemens Aera/Verio) from children aged 2-19 years at Gazi University (2015-2024). The dataset includes healthy children as well as patients diagnosed with AP or CP based on clinical criteria. Pediatric and general radiologists manually segmented the pancreas, then confirmed by a senior pediatric radiologist. PanSegNet-generated segmentations were assessed using Dice Similarity Coefficient (DSC) and 95th percentile Hausdorff distance (HD95). Cohen's kappa measured observer agreement. Results: Pancreas MRI T2W scans were obtained from 42 children with AP/CP (mean age: 11.73 +/- 3.9 years) and 42 healthy children (mean age: 11.19 +/- 4.88 years). PanSegNet achieved DSC scores of 88% (controls), 81% (AP), and 80% (CP), with HD95 values of 3.98 mm (controls), 9.85 mm (AP), and 15.67 mm (CP). Inter-observer kappa was 0.86 (controls), 0.82 (pancreatitis), and intra-observer agreement reached 0.88 and 0.81. Strong agreement was observed between automated and manual volumes (R^2 = 0.85 in controls, 0.77 in diseased), demonstrating clinical reliability. Conclusion: PanSegNet represents the first validated deep learning solution for pancreatic MRI segmentation, achieving expert-level performance across healthy and diseased states. This tool, algorithm, along with our annotated dataset, are freely available on GitHub and OSF, advancing accessible, radiation-free pediatric pancreatic imaging and fostering collaborative research in this underserved domain.
- Abstract(参考訳): 目的: 小児急性膵炎 (AP) , 慢性膵炎 (CP) , 健常者におけるMRIを用いた深層学習 (DL) アルゴリズムである PanSegNet の評価と評価を目的とした。
方法: ガジ大学(2015-2024)の2~19歳児から, 84個のMRIスキャン(1.5T/3T Siemens Aera/Verio)を回顧的に収集した。
このデータセットは、臨床基準に基づいて、健康な子供だけでなく、APまたはCPと診断された患者も含む。
小児科および一般放射線科医は、手動で膵を分類し、その後、小児科の放射線科医によって確認された。
PanSegNetの生成したセグメンテーションはDice similarity Coefficient (DSC) と95%のHausdorff distance (HD95) を用いて評価された。
コーエンのカッパは観察者合意を測定した。
結果:AP/CP42例(平均年齢:11.73歳/-3.9歳)と健常児42例(平均年齢:11.19歳/-4.88歳)の膵MRIT2Wスキャンが得られた。
PanSegNetのDSCスコアは88%(コントロール)、81%(AP)、80%(CP)でHD95値は3.98mm(コントロール)、9.85mm(AP)、15.67mm(CP)であった。
オブザーバ間カッパは0.86(対照)、膵炎0.82(膵炎)、およびオブザーバ内合意は0.88と0.81に達した。
自動ボリュームと手動ボリューム(コントロールではR^2=0.85、疾患では0.77)の間に強い一致がみられ,臨床的信頼性が示された。
結論: PanSegNetは、膵MRIのセグメンテーションのための最初の検証済みディープラーニングソリューションであり、健康状態と疾患のある状態にまたがって専門家レベルのパフォーマンスを達成する。
このアルゴリズムは、当社の注釈付きデータセットとともに、GitHubとOSFで自由に利用でき、アクセス可能で、放射線のない小児膵イメージングに到達し、この未保存領域における共同研究を促進する。
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