論文の概要: Do we need equivariant models for molecule generation?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.09753v1
- Date: Sun, 13 Jul 2025 19:16:11 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-15 18:48:23.957632
- Title: Do we need equivariant models for molecule generation?
- Title(参考訳): 分子生成のための同変モデルが必要か?
- Authors: Ewa M. Nowara, Joshua Rackers, Patricia Suriana, Pan Kessel, Max Shen, Andrew Martin Watkins, Michael Maser,
- Abstract要約: 回転強化により訓練された非同変畳み込みニューラルネットワーク(CNN)が等変モデルの等価性を学習し、同変モデルの性能に適合できるかどうかを検討する。
我々の知る限り、これは生成タスクにおける学習された同値性を分析する最初の研究である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.336105667374686
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep generative models are increasingly used for molecular discovery, with most recent approaches relying on equivariant graph neural networks (GNNs) under the assumption that explicit equivariance is essential for generating high-quality 3D molecules. However, these models are complex, difficult to train, and scale poorly. We investigate whether non-equivariant convolutional neural networks (CNNs) trained with rotation augmentations can learn equivariance and match the performance of equivariant models. We derive a loss decomposition that separates prediction error from equivariance error, and evaluate how model size, dataset size, and training duration affect performance across denoising, molecule generation, and property prediction. To our knowledge, this is the first study to analyze learned equivariance in generative tasks.
- Abstract(参考訳): 深い生成モデルは分子発見にますます使われており、最も最近のアプローチは、高品質な3D分子を生成するのに明示的な同値性が不可欠であるという前提の下で、同変グラフニューラルネットワーク(GNN)に依存している。
しかしながら、これらのモデルは複雑で、訓練が困難で、スケールが不十分です。
回転強化により訓練された非同変畳み込みニューラルネットワーク(CNN)が等変モデルの等価性を学習し、同変モデルの性能に適合できるかどうかを検討する。
予測誤差を等分散誤差から分離した損失分解を導出し,モデルサイズ,データセットサイズ,トレーニング期間が認知,分子生成,特性予測にどう影響するかを評価する。
我々の知る限り、これは生成タスクにおける学習された同値性を分析する最初の研究である。
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