論文の概要: A PBN-RL-XAI Framework for Discovering a "Hit-and-Run" Therapeutic Strategy in Melanoma
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.10136v4
- Date: Thu, 24 Jul 2025 04:04:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-25 15:10:42.116231
- Title: A PBN-RL-XAI Framework for Discovering a "Hit-and-Run" Therapeutic Strategy in Melanoma
- Title(参考訳): 悪性黒色腫の「ハイ・アンド・ラン」治療戦略を明らかにするためのPBN-RL-XAIフレームワーク
- Authors: Zhonglin Liu,
- Abstract要約: 抗PD-1免疫療法に対する自然抵抗性はメラノーマの主要な臨床的課題である。
患者腫瘍生検の転写データを用いた動的確率的ブールネットワークモデルを構築した。
2つのタンパク質 (LOXL2) のようなリシルオキシダーゼの4段階の一時的阻害が最も有効な戦略であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.8158530638728501
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Innate resistance to anti-PD-1 immunotherapy remains a major clinical challenge in metastatic melanoma, with the underlying molecular networks being poorly understood. To address this, we constructed a dynamic Probabilistic Boolean Network model using transcriptomic data from patient tumor biopsies to elucidate the regulatory logic governing therapy response. We then employed a reinforcement learning agent to systematically discover optimal, multi-step therapeutic interventions and used explainable artificial intelligence to mechanistically interpret the agent's control policy. The analysis revealed that a precisely timed, 4-step temporary inhibition of the lysyl oxidase like 2 protein (LOXL2) was the most effective strategy. Our explainable analysis showed that this ''hit-and-run" intervention is sufficient to erase the molecular signature driving resistance, allowing the network to self-correct without requiring sustained intervention. This study presents a novel, time-dependent therapeutic hypothesis for overcoming immunotherapy resistance and provides a powerful computational framework for identifying non-obvious intervention protocols in complex biological systems.
- Abstract(参考訳): 抗PD-1免疫療法に対する自然抵抗性は、転移性メラノーマにおいて主要な臨床的課題であり、基礎となる分子ネットワークは理解されていない。
そこで我々は, 患者腫瘍生検の転写データを用いて, 動的確率的ブールネットワークモデルを構築し, 治療反応の制御ロジックを解明した。
そこで我々は,最適な多段階治療介入を体系的に発見するために強化学習エージェントを使用し,説明可能な人工知能を用いてエージェントの制御ポリシーを機械的に解釈した。
解析の結果,リシルオキシダーゼ様2タンパク質 (LOXL2) の経時的4段階の一時的阻害が最も有効であった。
我々の説明可能な分析は、この'hit-and-run'介入は分子シグネチャ駆動抵抗を消すのに十分であり、持続的な介入を必要とせずにネットワークが自己修正できることを示した。
本研究は, 免疫療法抵抗を克服するための新しい時間依存的治療仮説を提示し, 複雑な生物学的システムにおける非予防的介入プロトコルを同定するための強力な計算枠組みを提供する。
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