論文の概要: Automated Vigilance State Classification in Rodents Using Machine Learning and Feature Engineering
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.14166v1
- Date: Tue, 08 Jul 2025 19:08:57 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-27 08:26:15.934177
- Title: Automated Vigilance State Classification in Rodents Using Machine Learning and Feature Engineering
- Title(参考訳): 機械学習と特徴工学を用いたげっ歯類の自動警戒状態分類
- Authors: Sankalp Jajee, Gaurav Kumar, Homayoun Valafar,
- Abstract要約: 本研究では,脳波記録(EEG)を小げっ歯類に分類するために,Team Neural Prognosticatorsによって開発された自動フレームワークを提案する。
このシステムは、高度な信号処理と機械学習を統合し、時間領域と周波数領域の両方のエンジニアリングされた特徴を活用する。
XGBoostモデルは、全体的な精度91.5%、精度86.8%、リコール81.2%、F1スコア83.5%を達成し、全てのベースライン法を上回った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5390962520179197
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Preclinical sleep research remains constrained by labor intensive, manual vigilance state classification and inter rater variability, limiting throughput and reproducibility. This study presents an automated framework developed by Team Neural Prognosticators to classify electroencephalogram (EEG) recordings of small rodents into three critical vigilance states paradoxical sleep (REM), slow wave sleep (SWS), and wakefulness. The system integrates advanced signal processing with machine learning, leveraging engineered features from both time and frequency domains, including spectral power across canonical EEG bands (delta to gamma), temporal dynamics via Maximum-Minimum Distance, and cross-frequency coupling metrics. These features capture distinct neurophysiological signatures such as high frequency desynchronization during wakefulness, delta oscillations in SWS, and REM specific bursts. Validated during the 2024 Big Data Health Science Case Competition (University of South Carolina Big Data Health Science Center, 2024), our XGBoost model achieved 91.5% overall accuracy, 86.8% precision, 81.2% recall, and an F1 score of 83.5%, outperforming all baseline methods. Our approach represents a critical advancement in automated sleep state classification and a valuable tool for accelerating discoveries in sleep science and the development of targeted interventions for chronic sleep disorders. As a publicly available code (BDHSC) resource is set to contribute significantly to advancements.
- Abstract(参考訳): 就寝前研究は、労働集約、手動警戒状態の分類、利子間変動、スループットの制限、再現性に制約されている。
本研究では,脳波記録(EEG)を3つの臨界警戒状態(REM),低波睡眠(SWS),覚醒状態(ウェイクフルネス)に分類するために,Team Neural Prognosticatorsによって開発された自動フレームワークを提案する。
このシステムは、高度な信号処理と機械学習を統合し、標準脳波帯(デルタからガンマまで)のスペクトルパワー、最大最小距離による時間ダイナミクス、周波数間カップリングメトリクスなど、時間領域と周波数領域の両方のエンジニアリングされた特徴を活用する。
これらの特徴は、ウェイクフルネス中の高周波脱同期、SWSにおけるデルタ振動、REM特異的バーストなどの異なる神経生理学的特徴を捉えている。
2024年のBig Data Health Science Case Competition (University of South Carolina Big Data Health Science Center, 2024)で検証された我々のXGBoostモデルは、総合精度91.5%、精度86.8%、リコール81.2%、F1スコア83.5%を達成している。
我々のアプローチは、自動睡眠状態分類における重要な進歩と、睡眠科学における発見の加速と慢性睡眠障害に対する標的治療の開発のための貴重なツールである。
公開されているコード(BDHSC)リソースは、進歩に大きく貢献するように設定されている。
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