論文の概要: Deep-Learning Investigation of Vibrational Raman Spectra for Plant-Stress Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.15772v1
- Date: Mon, 21 Jul 2025 16:27:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-22 20:51:32.481453
- Title: Deep-Learning Investigation of Vibrational Raman Spectra for Plant-Stress Analysis
- Title(参考訳): 植物ストレス解析のための振動ラマンスペクトルの深層学習による検討
- Authors: Anoop C. Patil, Benny Jian Rong Sng, Yu-Wei Chang, Joana B. Pereira, Chua Nam-Hai, Rajani Sarojam, Gajendra Pratap Singh, In-Cheol Jang, Giovanni Volpe,
- Abstract要約: 植物の生体分子は重要なストレス指標として機能し、継続的な健康モニタリングと早期疾患検出のための重要なマーカーを提供する。
従来のラマン分析は、蛍光背景の除去とラマンピークの事前識別を必要とするカスタマイズされたデータ処理に依存している。
本稿では,変分オートエンコーダに基づく完全自動化ワークフローであるDIVA(Deep-learning-based Investigation of Vibrational Raman spectra for plant-stress Analysis)を紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9287179270753105
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Detecting stress in plants is crucial for both open-farm and controlled-environment agriculture. Biomolecules within plants serve as key stress indicators, offering vital markers for continuous health monitoring and early disease detection. Raman spectroscopy provides a powerful, non-invasive means to quantify these biomolecules through their molecular vibrational signatures. However, traditional Raman analysis relies on customized data-processing workflows that require fluorescence background removal and prior identification of Raman peaks of interest-introducing potential biases and inconsistencies. Here, we introduce DIVA (Deep-learning-based Investigation of Vibrational Raman spectra for plant-stress Analysis), a fully automated workflow based on a variational autoencoder. Unlike conventional approaches, DIVA processes native Raman spectra-including fluorescence backgrounds-without manual preprocessing, identifying and quantifying significant spectral features in an unbiased manner. We applied DIVA to detect a range of plant stresses, including abiotic (shading, high light intensity, high temperature) and biotic stressors (bacterial infections). By integrating deep learning with vibrational spectroscopy, DIVA paves the way for AI-driven plant health assessment, fostering more resilient and sustainable agricultural practices.
- Abstract(参考訳): 植物におけるストレスの検出は、オープンファームとコントロールされた環境農業の両方に不可欠である。
植物の生体分子は重要なストレス指標として機能し、継続的な健康モニタリングと早期疾患検出のための重要なマーカーを提供する。
ラマン分光法は、分子振動シグネチャを通じてこれらの生体分子を定量化するための強力で非侵襲的な手段を提供する。
しかし、従来のRaman分析は、蛍光背景の除去とRamanのピークの事前識別を必要とするカスタマイズされたデータ処理ワークフローに依存している。
本稿では,変分オートエンコーダに基づく完全自動化ワークフローであるDIVA(Deep-learning-based Investigation of Vibrational Raman spectra for plant-stress Analysis)を紹介する。
従来のアプローチとは異なり、DIVAはラマンスペクトルを含むネイティブな蛍光背景を手動前処理なしで処理し、バイアスのない方法で重要なスペクトルの特徴を特定し定量化する。
本研究はDIVAを用いて,無菌性ストレス(陰影,高光度,高温)および生物性ストレス(細菌感染症)の検知を行った。
深層学習と振動分光を組み合わせることで、DIVAはAI駆動の植物健康評価の道を開き、より弾力的で持続可能な農業プラクティスを育む。
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