論文の概要: Mantis: A Simulation-Grounded Foundation Model for Disease Forecasting
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.12260v3
- Date: Sun, 02 Nov 2025 11:36:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-04 16:14:22.190501
- Title: Mantis: A Simulation-Grounded Foundation Model for Disease Forecasting
- Title(参考訳): Mantis: 疾患予測のためのシミュレーション付き基礎モデル
- Authors: Carson Dudley, Reiden Magdaleno, Christopher Harding, Ananya Sharma, Emily Martin, Marisa Eisenberg,
- Abstract要約: マンティス(Mantis)は、メカニカルシミュレーションで完全に訓練された基礎モデルである。
マンティスは、初期のパンデミックの予報で裏付けられたとき、CDCのCOVID-19予測ハブの全てのモデルよりも平均絶対誤差を低くした。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Infectious disease forecasting in novel outbreaks or low-resource settings is hampered by the need for disease-specific data, bespoke training, and expert tuning. We introduce Mantis, a foundation model trained entirely on mechanistic simulations, which enables out-of-the-box forecasting across diseases, regions, and outcomes, even in settings with limited historical data. We evaluated Mantis against 48 forecasting models across six diseases with diverse transmission modes, assessing both point forecast accuracy (mean absolute error) and probabilistic performance (weighted interval score and coverage). Despite using no real-world data during training, Mantis achieved lower mean absolute error than all models in the CDC's COVID-19 Forecast Hub when backtested on early pandemic forecasts. Across all other diseases tested, including respiratory, vector-borne, and waterborne pathogens, Mantis consistently ranked in the top two models across all evaluation metrics. Notably, Mantis generalized to diseases with transmission mechanisms not represented in its training data, demonstrating that it captures fundamental contagion dynamics rather than memorizing disease-specific patterns. These capabilities position Mantis as a practical foundation for disease forecasting: general-purpose, accurate, and deployable where traditional models fail.
- Abstract(参考訳): 新規のアウトブレイクや低リソース環境における感染症の予測は、病原性データ、造血訓練、専門家のチューニングの必要性によって妨げられている。
歴史的データに制限のある設定でも,病気,地域,成果のアウト・オブ・ボックス予測を可能にする,メカニスティック・シミュレーションを全面的にトレーニングした基礎モデルであるMantisを紹介した。
本研究は,6つの疾患を対象とした48の予測モデルと比較し,点予測精度(絶対誤差)と確率的性能(重み付き間隔スコアとカバレッジ)を評価した。
トレーニング中に実際のデータを使用しなかったにもかかわらず、マンティスは初期のパンデミックの予測に裏打ちされたとき、CDCのCOVID-19予測ハブの全てのモデルよりも平均絶対誤差を低くした。
呼吸器、ベクターに感染する病原体、水に感染する病原体など、検査された他のすべての病原体の中で、マンティスはあらゆる評価指標の上位2モデルに一貫してランクインした。
特にマンティスは、その訓練データに表現されない伝達機構を持つ疾患に一般化し、疾患固有のパターンを記憶するよりも、基本的な伝染動態を捉えることを実証した。
これらの能力は、マンティスを病気予測の実践的な基盤として位置づけている。
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