論文の概要: UNITE: Uncertainty-based Health Risk Prediction Leveraging Multi-sourced
Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.11389v2
- Date: Sun, 25 Apr 2021 20:47:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-04 07:17:39.106784
- Title: UNITE: Uncertainty-based Health Risk Prediction Leveraging Multi-sourced
Data
- Title(参考訳): UNITE:マルチソースデータを活用した不確実性に基づく健康リスク予測
- Authors: Chacha Chen, Junjie Liang, Fenglong Ma, Lucas M. Glass, Jimeng Sun and
Cao Xiao
- Abstract要約: 我々はUNcertaInTyベースのhEalth Risk Prediction(UNITE)モデルを提案する。
UNITEは、複数ソースの健康データを活用した正確な疾患リスク予測と不確実性推定を提供する。
非アルコール性脂肪肝疾患(NASH)とアルツハイマー病(AD)の実態予測タスクにおけるUNITEの評価を行った。
UNITEはAD検出のF1スコアで最大0.841点、NASH検出のPR-AUCで最大0.609点を達成し、最高のベースラインで最大19%の高パフォーマンスを達成している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 81.00385374948125
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Successful health risk prediction demands accuracy and reliability of the
model. Existing predictive models mainly depend on mining electronic health
records (EHR) with advanced deep learning techniques to improve model accuracy.
However, they all ignore the importance of publicly available online health
data, especially socioeconomic status, environmental factors, and detailed
demographic information for each location, which are all strong predictive
signals and can definitely augment precision medicine. To achieve model
reliability, the model needs to provide accurate prediction and uncertainty
score of the prediction. However, existing uncertainty estimation approaches
often failed in handling high-dimensional data, which are present in
multi-sourced data. To fill the gap, we propose UNcertaInTy-based hEalth risk
prediction (UNITE) model. Building upon an adaptive multimodal deep kernel and
a stochastic variational inference module, UNITE provides accurate disease risk
prediction and uncertainty estimation leveraging multi-sourced health data
including EHR data, patient demographics, and public health data collected from
the web. We evaluate UNITE on real-world disease risk prediction tasks:
nonalcoholic fatty liver disease (NASH) and Alzheimer's disease (AD). UNITE
achieves up to 0.841 in F1 score for AD detection, up to 0.609 in PR-AUC for
NASH detection, and outperforms various state-of-the-art baselines by up to
$19\%$ over the best baseline. We also show UNITE can model meaningful
uncertainties and can provide evidence-based clinical support by clustering
similar patients.
- Abstract(参考訳): 健康リスク予測が成功すると、モデルの正確性と信頼性が要求される。
既存の予測モデルは、モデル精度を改善するための高度な深層学習技術を備えた電子健康記録(EHR)に大きく依存している。
しかし、オンライン健康データ、特に社会経済状況、環境要因、そして各場所の詳細な人口統計情報の重要性は、いずれも強力な予測信号であり、精密医療を増強することができる。
モデルの信頼性を達成するためには、予測の正確な予測と不確実性スコアを提供する必要がある。
しかし、既存の不確実性推定手法は、多ソースデータに存在する高次元データを扱うのにしばしば失敗する。
このギャップを埋めるために、UNcertaInTyベースのhEalth Risk Prediction (UNITE)モデルを提案する。
UNITEは、適応型マルチモーダルディープカーネルと確率的変動推論モジュールに基づいて、EHRデータ、患者統計、Webから収集された公衆衛生データを含むマルチソースの健康データを活用する、正確な疾患リスク予測と不確実性推定を提供する。
我々は,非アルコール性脂肪肝疾患 (NASH) とアルツハイマー病 (AD) の実際の疾患リスク予測タスクにおけるUNITEの評価を行った。
UNITEはAD検出のF1スコアで最大0.841点、NASH検出のPR-AUCで最大0.609点を達成し、最高のベースラインで最大19.%の高パフォーマンスを実現している。
また,uniteは有意義な不確かさをモデル化し,類似した患者をクラスタリングすることでエビデンスに基づく臨床支援を提供できることを示した。
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