論文の概要: DyMorph-B2I: Dynamic and Morphology-Guided Binary-to-Instance Segmentation for Renal Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.15208v1
- Date: Thu, 21 Aug 2025 03:41:07 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-22 16:26:46.167979
- Title: DyMorph-B2I: Dynamic and Morphology-Guided Binary-to-Instance Segmentation for Renal Pathology
- Title(参考訳): DyMorph-B2I: 腎疾患に対する動的および形態誘導型バイナリ・インスタンス・セグメンテーション
- Authors: Leiyue Zhao, Yuechen Yang, Yanfan Zhu, Haichun Yang, Yuankai Huo, Paul D. Simonson, Kenji Ikemura, Mert R. Sabuncu, Yihe Yang, Ruining Deng,
- Abstract要約: DyMorph-B2Iは、腎病理に適合した動的、モルフォロジー誘導二元間セグメンテーションパイプラインである。
当社のアプローチでは,統合されたフレームワーク内に流域,骨格化,形態的操作を統合する。
我々の手法は、個々の古典的アプローチとナチ的組み合わせより優れています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.794482892606199
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate morphological quantification of renal pathology functional units relies on instance-level segmentation, yet most existing datasets and automated methods provide only binary (semantic) masks, limiting the precision of downstream analyses. Although classical post-processing techniques such as watershed, morphological operations, and skeletonization, are often used to separate semantic masks into instances, their individual effectiveness is constrained by the diverse morphologies and complex connectivity found in renal tissue. In this study, we present DyMorph-B2I, a dynamic, morphology-guided binary-to-instance segmentation pipeline tailored for renal pathology. Our approach integrates watershed, skeletonization, and morphological operations within a unified framework, complemented by adaptive geometric refinement and customizable hyperparameter tuning for each class of functional unit. Through systematic parameter optimization, DyMorph-B2I robustly separates adherent and heterogeneous structures present in binary masks. Experimental results demonstrate that our method outperforms individual classical approaches and na\"ive combinations, enabling superior instance separation and facilitating more accurate morphometric analysis in renal pathology workflows. The pipeline is publicly available at: https://github.com/ddrrnn123/DyMorph-B2I.
- Abstract(参考訳): 腎病理機能単位の正確な形態的定量化は、インスタンスレベルのセグメンテーションに依存しているが、既存のデータセットや自動化された手法は、下流分析の精度を制限し、二項(セマンティック)マスクのみを提供する。
分水界、形態学的操作、骨格化のような古典的な後処理技術は、しばしばセマンティックマスクをインスタンスに分けるために使用されるが、それらの個々の効果は、腎組織に見られる様々な形態と複雑な接続によって制約される。
本研究では, 腎病理学に適した動的, 形態誘導型バイナリ・ツー・インスタンス・セグメンテーションパイプラインであるDyMorph-B2Iについて述べる。
本手法は,機能単位のクラスごとに適応的な幾何改良とカスタマイズ可能なハイパーパラメータチューニングによって補完される,統一された枠組み内での流域,骨格化,形態的操作を統合する。
体系的なパラメータ最適化を通じて、DyMorph-B2Iは二元マスクに存在する付着構造と不均一構造を強く分離する。
実験結果から,本手法は個々の古典的アプローチと「na\」の組み合わせよりも優れており,より優れた症例分離が可能であり,腎疾患のワークフローにおけるより正確な形態計測分析を容易にすることが示唆された。
パイプラインは、https://github.com/ddrrnn123/DyMorph-B2Iで公開されている。
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