論文の概要: Ensemble learning of foundation models for precision oncology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.16085v1
- Date: Fri, 22 Aug 2025 04:36:10 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-25 16:42:36.251617
- Title: Ensemble learning of foundation models for precision oncology
- Title(参考訳): 精度オンコロジーのための基礎モデルのアンサンブル学習
- Authors: Xiangde Luo, Xiyue Wang, Feyisope Eweje, Xiaoming Zhang, Sen Yang, Ryan Quinton, Jinxi Xiang, Yuchen Li, Yuanfeng Ji, Zhe Li, Yijiang Chen, Colin Bergstrom, Ted Kim, Francesca Maria Olguin, Kelley Yuan, Matthew Abikenari, Andrew Heider, Sierra Willens, Sanjeeth Rajaram, Robert West, Joel Neal, Maximilian Diehn, Ruijiang Li,
- Abstract要約: ELF(Ensemble Learning of Foundation Model)は,5つの最先端の病理基盤モデルを統合し,統合されたスライドレベル表現を生成する新しいフレームワークである。
ELFは、すべての構成基盤モデルと既存のスライドレベルモデルに一貫して優れており、精度と堅牢性に優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.813705315667438
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Histopathology is essential for disease diagnosis and treatment decision-making. Recent advances in artificial intelligence (AI) have enabled the development of pathology foundation models that learn rich visual representations from large-scale whole-slide images (WSIs). However, existing models are often trained on disparate datasets using varying strategies, leading to inconsistent performance and limited generalizability. Here, we introduce ELF (Ensemble Learning of Foundation models), a novel framework that integrates five state-of-the-art pathology foundation models to generate unified slide-level representations. Trained on 53,699 WSIs spanning 20 anatomical sites, ELF leverages ensemble learning to capture complementary information from diverse models while maintaining high data efficiency. Unlike traditional tile-level models, ELF's slide-level architecture is particularly advantageous in clinical contexts where data are limited, such as therapeutic response prediction. We evaluated ELF across a wide range of clinical applications, including disease classification, biomarker detection, and response prediction to major anticancer therapies, cytotoxic chemotherapy, targeted therapy, and immunotherapy, across multiple cancer types. ELF consistently outperformed all constituent foundation models and existing slide-level models, demonstrating superior accuracy and robustness. Our results highlight the power of ensemble learning for pathology foundation models and suggest ELF as a scalable and generalizable solution for advancing AI-assisted precision oncology.
- Abstract(参考訳): 病理は疾患の診断と治療の意思決定に不可欠である。
人工知能(AI)の最近の進歩により、大規模全スライド画像(WSI)からリッチな視覚表現を学習する病理基盤モデルの開発が可能になった。
しかし、既存のモデルは様々な戦略を用いて異なるデータセットで訓練されることが多く、一貫性のない性能と限定的な一般化性がもたらされる。
本稿では、5つの最先端の病理基盤モデルを統合した新しいフレームワークであるELF(Ensemble Learning of Foundation Model)を紹介し、スライドレベルの統一表現を生成する。
20の解剖学的部位にまたがる53,699のWSIでトレーニングされたELFは、アンサンブル学習を活用して、さまざまなモデルから補完的な情報をキャプチャし、高いデータ効率を維持している。
従来のタイルレベルのモデルとは異なり、ELFのスライドレベルのアーキテクチャは、治療応答予測など、データが制限された臨床状況において特に有利である。
疾患分類,バイオマーカー検出,主要な抗がん療法に対する反応予測,細胞傷害化学療法,標的療法,免疫療法など,多種多様な臨床応用について検討した。
ELFは、すべての構成基盤モデルと既存のスライドレベルモデルに一貫して優れており、精度と堅牢性を示している。
本結果は,病理基盤モデルにおけるアンサンブル学習のパワーを強調し,AI支援精度オンコロジーの進展のためのスケーラブルで一般化可能なソリューションとしてELFを提案する。
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