論文の概要: Self-supervised large-scale kidney abnormality detection in drug safety assessment studies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.00131v1
- Date: Fri, 29 Aug 2025 14:13:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-04 15:17:03.098081
- Title: Self-supervised large-scale kidney abnormality detection in drug safety assessment studies
- Title(参考訳): 薬物安全性評価研究における自己監督型大規模腎異常検出
- Authors: Ivan Slootweg, Natalia P. García-De-La-Puente, Geert Litjens, Salma Dammak,
- Abstract要約: 今回,腎毒性疾患に対する自己監督型自己監督型異常検出モデルについて紹介する。
また,同一機能に適用した自己教師型手法により,より高精度な性能が得られることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.8803849113863373
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Kidney abnormality detection is required for all preclinical drug development. It involves a time-consuming and costly examination of hundreds to thousands of whole-slide images per drug safety study, most of which are normal, to detect any subtle changes indicating toxic effects. In this study, we present the first large-scale self-supervised abnormality detection model for kidney toxicologic pathology, spanning drug safety assessment studies from 158 compounds. We explore the complexity of kidney abnormality detection on this scale using features extracted from the UNI foundation model (FM) and show that a simple k-nearest neighbor classifier on these features performs at chance, demonstrating that the FM-generated features alone are insufficient for detecting abnormalities. We then demonstrate that a self-supervised method applied to the same features can achieve better-than-chance performance, with an area under the receiver operating characteristic curve of 0.62 and a negative predictive value of 89%. With further development, such a model can be used to rule out normal slides in drug safety assessment studies, reducing the costs and time associated with drug development.
- Abstract(参考訳): 腎臓の異常検出は、すべての前臨床薬の開発に必要である。
薬の安全性研究にあたり、何百から何千ものスライディング画像の検査に要する時間と費用がかかり、その多くは正常で、有害な影響を示す微妙な変化を検出する。
本研究では,158化合物の薬物安全性評価研究を対象とし,腎毒性疾患に対する自己監督型自己監督型異常検出モデルについて検討した。
UNIファンデーションモデル(FM)から抽出した特徴を用いて腎臓の異常検出の複雑さを考察し,これらの特徴の簡単なk-nearest近傍分類器が偶然に機能し,FM生成した特徴だけでは異常検出に不十分であることを示す。
次に,同一機能に適用した自己教師型手法により,受信機動作特性曲線0.62以下の領域と負の予測値89%の領域において,より精度の高い性能が得られることを示す。
さらなる開発では、医薬品の安全性評価研究における通常のスライドを排除し、医薬品開発に関連するコストと時間を削減できる。
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