論文の概要: NMR-Solver: Automated Structure Elucidation via Large-Scale Spectral Matching and Physics-Guided Fragment Optimization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.00640v1
- Date: Sat, 30 Aug 2025 23:59:12 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-04 15:17:03.316854
- Title: NMR-Solver: Automated Structure Elucidation via Large-Scale Spectral Matching and Physics-Guided Fragment Optimization
- Title(参考訳): NMRソルバー:大規模スペクトルマッチングと物理誘導フラッグメント最適化による構造解明
- Authors: Yongqi Jin, Jun-Jie Wang, Fanjie Xu, Xiaohong Ji, Zhifeng Gao, Linfeng Zhang, Guolin Ke, Rong Zhu, Weinan E,
- Abstract要約: 核磁気共鳴分光法(英: Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy、NMR)は、有機化学において最も強力で広く用いられている分子構造解明法の一つである。
本稿では,小さな有機分子構造を1ドルHおよび13ドルCのNMRスペクトルから自動決定するための,実用的で解釈可能なフレームワークであるNMR-rについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 24.714189961887215
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy is one of the most powerful and widely used tools for molecular structure elucidation in organic chemistry. However, the interpretation of NMR spectra to determine unknown molecular structures remains a labor-intensive and expertise-dependent process, particularly for complex or novel compounds. Although recent methods have been proposed for molecular structure elucidation, they often underperform in real-world applications due to inherent algorithmic limitations and limited high-quality data. Here, we present NMR-Solver, a practical and interpretable framework for the automated determination of small organic molecule structures from $^1$H and $^{13}$C NMR spectra. Our method introduces an automated framework for molecular structure elucidation, integrating large-scale spectral matching with physics-guided fragment-based optimization that exploits atomic-level structure-spectrum relationships in NMR. We evaluate NMR-Solver on simulated benchmarks, curated experimental data from the literature, and real-world experiments, demonstrating its strong generalization, robustness, and practical utility in challenging, real-life scenarios. NMR-Solver unifies computational NMR analysis, deep learning, and interpretable chemical reasoning into a coherent system. By incorporating the physical principles of NMR into molecular optimization, it enables scalable, automated, and chemically meaningful molecular identification, establishing a generalizable paradigm for solving inverse problems in molecular science.
- Abstract(参考訳): 核磁気共鳴分光法(英: Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy、NMR)は、有機化学において最も強力で広く用いられている分子構造解明法の一つである。
しかし、未知の分子構造を決定するためのNMRスペクトルの解釈は、特に複雑な化合物や新規化合物に対して、労働集約的で専門性に依存したプロセスのままである。
近年,分子構造解明のための手法が提案されているが,本質的なアルゴリズム的制限や高品質なデータに制約があるため,実世界の応用では性能が劣っていることが多い。
ここでは, NMR-Solverについて述べる。これは, $^1$H および $^{13}$C NMRスペクトルから小さな有機分子構造を自動決定するための実用的で解釈可能なフレームワークである。
本手法では,分子構造解明のための自動フレームワークを導入し,NMRにおける原子レベル構造-スペクトル関係を利用した物理誘導フラグメントベース最適化と大規模スペクトルマッチングを統合する。
我々は, NMR-Solverをシミュレーションしたベンチマーク, 文献からのキュレートされた実験データ, 実世界の実験で評価し, その強力な一般化, 堅牢性, 実用性を, 挑戦的で現実的なシナリオで実証した。
NMRソルバーは計算NMR分析、深層学習、解釈可能な化学推論をコヒーレントシステムに統合する。
NMRの物理原理を分子最適化に取り入れることで、スケーラブルで自動化され、化学的に意味のある分子識別を可能にし、分子科学における逆問題を解決するための一般化可能なパラダイムを確立する。
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