論文の概要: Challenges in Deep Learning-Based Small Organ Segmentation: A Benchmarking Perspective for Medical Research with Limited Datasets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.05892v1
- Date: Sun, 07 Sep 2025 01:54:20 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-09 14:07:03.766917
- Title: Challenges in Deep Learning-Based Small Organ Segmentation: A Benchmarking Perspective for Medical Research with Limited Datasets
- Title(参考訳): 深層学習に基づく小臓器分節化の課題--限られたデータセットを用いた医学研究のベンチマーク・パースペクティブ
- Authors: Phongsakon Mark Konrad, Andrei-Alexandru Popa, Yaser Sabzehmeidani, Liang Zhong, Elisa A. Liehn, Serkan Ayvaz,
- Abstract要約: 本研究では,最先端のディープラーニングセグメンテーションモデルの体系的評価について検討する。
その結果, モデル性能はデータ分割に非常に敏感であり, 統計的ノイズによる差は, 真のアルゴリズム上の優越性よりも小さいことがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.2648105980808475
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of carotid artery structures in histopathological images is vital for advancing cardiovascular disease research and diagnosis. However, deep learning model development in this domain is constrained by the scarcity of annotated cardiovascular histopathological data. This study investigates a systematic evaluation of state-of-the-art deep learning segmentation models, including convolutional neural networks (U-Net, DeepLabV3+), a Vision Transformer (SegFormer), and recent foundation models (SAM, MedSAM, MedSAM+UNet), on a limited dataset of cardiovascular histology images. Despite employing an extensive hyperparameter optimization strategy with Bayesian search, our findings reveal that model performance is highly sensitive to data splits, with minor differences driven more by statistical noise than by true algorithmic superiority. This instability exposes the limitations of standard benchmarking practices in low-data clinical settings and challenges the assumption that performance rankings reflect meaningful clinical utility.
- Abstract(参考訳): 病理組織像における頸動脈の正確な分節化は,心血管疾患の研究・診断の進展に不可欠である。
しかし, この領域における深層学習モデルの開発は, 注釈付心血管病理データの不足に制約されている。
本研究では、畳み込みニューラルネットワーク(U-Net, DeepLabV3+)、視覚変換器(SegFormer)、最近の基礎モデル(SAM, MedSAM, MedSAM+UNet)を含む最先端のディープラーニングセグメンテーションモデルについて、限られた心血管組織像のデータセットを用いて、体系的に評価する。
ベイジアン探索による広範なハイパーパラメータ最適化戦略を取り入れた結果、モデル性能はデータ分割に非常に敏感であり、その差は真のアルゴリズム上の優越性よりも統計ノイズに強く依存していることが判明した。
この不安定性は、低データ臨床環境での標準ベンチマークプラクティスの限界を明らかにし、パフォーマンスランキングが有意義な臨床的有用性を反映しているという仮定に挑戦する。
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