論文の概要: HyKid: An Open MRI Dataset with Expert-Annotated Multi-Structure and Choroid Plexus in Pediatric Hydrocephalus
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.19218v1
- Date: Tue, 23 Sep 2025 16:42:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-24 20:41:27.953597
- Title: HyKid: An Open MRI Dataset with Expert-Annotated Multi-Structure and Choroid Plexus in Pediatric Hydrocephalus
- Title(参考訳): HyKid:小児水頭症における有意なマルチ構造と脈絡膜叢を有するオープンMRIデータセット
- Authors: Yunzhi Xu, Yushuang Ding, Hu Sun, Hongxi Zhang, Li Zhao,
- Abstract要約: 小児水頭症48例のオープンソースデータセットであるHyKidについて紹介する。
3次元MRIに1mm等方分解能を付与し,スライス・ツー・ボリューム・アルゴリズムを用いて低解像度画像から再構成した。
Retrieval-Augmented Generation frameworkを用いて臨床放射線学報告から構造化データを抽出した。
脈絡叢容積と総CSF容積との強い相関は,脳波評価のための潜在的なバイオマーカーとなり,予測モデルにおいて優れた性能を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7019589902619554
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Evaluation of hydrocephalus in children is challenging, and the related research is limited by a lack of publicly available, expert-annotated datasets, particularly those with segmentation of the choroid plexus. To address this, we present HyKid, an open-source dataset from 48 pediatric patients with hydrocephalus. 3D MRIs were provided with 1mm isotropic resolution, which was reconstructed from routine low-resolution images using a slice-to-volume algorithm. Manually corrected segmentations of brain tissues, including white matter, grey matter, lateral ventricle, external CSF, and the choroid plexus, were provided by an experienced neurologist. Additionally, structured data was extracted from clinical radiology reports using a Retrieval-Augmented Generation framework. The strong correlation between choroid plexus volume and total CSF volume provided a potential biomarker for hydrocephalus evaluation, achieving excellent performance in a predictive model (AUC = 0.87). The proposed HyKid dataset provided a high-quality benchmark for neuroimaging algorithms development, and it revealed the choroid plexus-related features in hydrocephalus assessments. Our datasets are publicly available at https://www.synapse.org/Synapse:syn68544889.
- Abstract(参考訳): 小児における水頭症の評価は困難であり、関連する研究は、特に脈絡膜叢の分節を伴う、公開可能な専門家によるデータセットの欠如によって制限されている。
そこで我々は,48名の小児水頭症患者のオープンソースデータセットHyKidを提案する。
3次元MRIに1mm等方分解能を付与し,スライス・ツー・ボリューム・アルゴリズムを用いて低解像度画像から再構成した。
経験豊富な神経学者により,白質,灰白質,側心室,外心室,脈絡膜叢などの脳組織の手動補正を行った。
また,Retrieval-Augmented Generationフレームワークを用いて臨床放射線学報告から構造化データを抽出した。
脈絡叢体積と総CSF体積との強い相関は,脳波評価のための潜在的なバイオマーカーとなり,予測モデル(AUC = 0.87)において優れた性能を示した。
提案したHyKidデータセットは、神経画像アルゴリズム開発のための高品質なベンチマークを提供し、脳波評価における脈絡膜叢に関連する特徴を明らかにした。
データセットはhttps://www.synapse.org/Synapse:syn68544889で公開されています。
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